为了充分利用生物工程过程的潜力，在该过程的各阶段所用的培养基成分调配得很合适是十分重要的。这些阶段包括有:接种菌的制备、各子培养、最后的生产阶段。
 

　　生物体的特异性需要，易于在实脸室水平上加以确定，然 后再放大成生产水平。在使用大规模发发酵罐时，要特别强调选 用配料，配料应浅是易于得到的、能再生的、稳定的和易于 管理和贮存的。在所有这一切中，配料的价格又起很主要的 作用，因为生物工程过程成功与否，在很大程度上决定于此过程与生产同一产品的其他方法相比较经济效益如何?此 外，因为世界商品价格十分不稳定,所以设 计培养基必须善于选用配料。
 

　　许多生物工程的原料需用量很大，必须特别注意贮存以防发生化学变化和微生物污染。
 

　　工作人员的健康也必须特别注意，尤其是在处理粉状物时。配制培养基是不大让人感兴趣的工作，可是这是全部操 作过程的基础 ,培养基设计得不好会导致生物生长效率低以 及随之而来的产物形成得少。
 

　　由于大多数发酵过程是用单一的纯培养微生物的方法， 因此在发酵中的所有培养基必须没有其他微生物污染。工业培养基普遍使用的灭菌方法是在加压下用蒸气加热。培养基 灭菌要求做到培养基成份受到的处理是温和的，而又能将所有不需要的微生物全部除掉。