只要有总离子流色谱图，就可以提取扫描质量范围内任何质量的离子流图，即质量色谱图。质量色谱图可以提供许多信息，应用它可解决许多问题，如色谱峰纯度检查、追踪目标化合物、确定同系物的碳数分布范围、进行准确定量等，所以被称为质量色谱法。

(1)色谱峰纯度检查和准确定量，质量色谱法可以帮助鉴别共流出组分，做色谱峰纯度检查。又因为质量色谐将两个组分*分开了，而色谱峰则未*分开，所以用质量色谱峰面积进行定量比用色谱峰面积定量要准确得多。

(2)目标化合物追踪邻苯二甲酸酯类是常见的增缩剂，在分析试验室中几乎*，各种塑料包装、塑料瓶盖、样品预处理用的一些试剂、硅胶、树脂等都含有此类化合物。它们的沸点较高，容易残留在色谱柱中，柱温升高到200C以上就会流出。往往在GC/MS分析前做空白试验时，检查是否有这类化合物残留，可采用质量色谱追踪，如果有这类化合物很容易检查出来。由邻苯二甲酸丁酯和邻苯二甲酸辛酯的质谱图可知，它们有非常强的特征离子m/z 149。在空白试验或考察GC/MS联用本底时，采集数据过程中用m/z -149离子流图实时追踪，或从数据采集后得到的TIC图中提取m/z149质量色谱图，都能很快判断它们是否存在。