多层薄膜通常用于食品和药品的包装袋。用以测量每层薄膜的成分的最常见方法是，将薄膜切出横截面，利用红外显微透射法对所得试样进行测量。使用这种方法时，如果薄膜的厚度为10μm或以上，那么可以测量出每层薄膜的光谱。

在此实例中，利用切片机对本试样进行切割，切割厚度为10μm。将切割后的横截面放置在金刚石透射池上，然后进行挤压，最后利用红外显微镜进行测量。图1展示的是在挤压前的横截面的放大图。图2是挤压后横截面的放大图。图2中7层薄膜的光谱参见图3。基于每个光谱的吸收特性，第1层薄膜可能是聚对苯二甲酸乙酯；第2、6、7层薄膜可能是聚乙烯；第3层薄膜可能是尼龙；第4和5层薄膜可能是乙烯-醋酸乙烯酯。

FTIR红外光谱仪的主要用途是估计有机化合物的结构。该仪器将红外光线照射在分子上，分子吸收红外辐射（相当于组成这些分子的原子之间的振动能量），然后对其结构进行估计，最后通过红外吸收的方法对该化合物做出定量分析。

将红外显微镜与FTIR光谱仪联用，甚至可以测量出大约10μm的微小污染物。