冷冻干燥机在冻干操作过程中的禁止事项有：

（1）没有正确安装的情况下请勿使用
（2）没有面板时请勿使用
（3）未经允许请勿使用
（4）搁板没放好请勿使用
（5）没有特殊安全措施时不能冻干具有腐蚀性物质。即使有保护的情况下也要保证不会腐蚀主机材料不会降低冷阱、干燥腔、盖子和其他附件的机械强度。
（6）生产者不允许私自添加附件除了一些玻璃或塑料的容器。如果容器质量较差请勿使用因为冻干时容器爆裂是非常危险的。
（7）不要在具有爆炸危险性的区域使用冻干机。
（8）冻干机在使用过程中不要撞击或移动，也不要倚靠或在上面休息。
（9）不要将具有潜在危险性的物体如装有液体的瓶子放在冻干机附近。
（10）可与冻干时供给的能量发生反应的样品不能被干燥。
（11）不要冻干爆炸性或易燃性样品。
（12）传染性、有毒的、致病的和具有放射性的物质必须放在合适的容器中才能干燥。