PCR实验室核酸检测具体流程
时间:2020-04-25 阅读:20379
PCR实验室核酸检测具体流程
近日,北京协和发布了病毒核酸检测标准操作流程的培训视频,供其他符合条件的医疗机构在开展病毒核酸检测时参考。仪器信息网特将其整理成文字版本供大家方便查看。
一、个人三级防护穿戴
带一次性帽子、佩戴医用N95、一次性防护服、一次性鞋套、一次性防水靴套、一层乳胶手套、外层一次性隔离衣、防护目镜、第二层乳胶手套、穿戴完毕后应尽快通过缓冲间或者走廊,进入核酸提取区(业核酸提取实验室)。
二、样本灭活处理
核酸检测须有两名工作人员快速通过进入实验室,进行灭活实验操作。生物安全柜内需配备吸水棉与消毒酒精、有条件可配备吸水台布,对样本溢洒时进行紧急处理;打开二级容器,用75%酒精消毒物体表面,检测样本管密闭性后进行灭活处理,灭活条件(56℃,30min,恒温样本灭菌仪等多种方式),取出酒精灭活管用酒精擦拭外表,将样本放入到生物安全柜内。
三、手工核酸提取
操作人员进入试剂配置区或者单独的洁净实验室。
一、试剂区准备
根据说明说要求,在AW1中加入无水乙醇130mL,在AW2中加入无水乙醇160mL,计入无水乙醇后及时做好标记,在310μg的Carrier RNA中加入310μL AVE,并颠倒混匀使Carrier RNA充分溶解,就此完成洗液AW1、洗液AW2和Carrier RNA配置,而后通过传递窗传送到样本处理区,或者由人送到核酸提取实验室中。
二、样本的裂解
用1.5ml的无菌EP管,移液器移取560μl AVL裂解液,加入5.6μl Carrier RNA,加入140μl的已灭活的待提取核酸的待测样本,涡旋振荡15s,室温静止10min。将上述EP管放入离心机内瞬时离心以去除可能残留在EP管盖上的裂解产物,防止污染。裂解完成后,加入560μl无水乙醇,振荡混匀15s,将上述EP管放入离心机内瞬时离心以去除可能残留在EP管盖上的裂解产物,防止污染。
向离心柱加入裂解产物630μl,8000转离心1min,若离心机在生物安全柜之外,每次使用都需进行外表面消毒。更换新废液收集管,要从离心机中小心取出离心柱,将上层离心柱转移到新收集管中,继续将剩余裂解产物630μl加入离心柱中,若样本体积大于140μl时需重复此步骤,直到全部裂解产物都过柱离心,8000转离心1min,小心将离心柱转移到新的收集管中。
取500μl AW1加入离心柱中(注意,此处加样操作时务必将移液器吸头接触离心柱内壁缓慢加样),8000转离心1min。小心取出离心柱,更换新的收集管。
取500μl AW2加入离心柱中,14000转离心3min,小心取出离心柱,更换新的离心柱上端收集管,置于离心机中使用大转速离心1min,以确保将AW2中的残液*离心干净。
取无菌1.5mlEP管收集核酸,将离心柱上端小心放入1.5mlEP管中,取40-60μl的洗脱液AVE加入到离心柱中(注意:洗脱液应尽量全部覆盖住离心柱膜),用EP管管盖盖住离心柱,使用无菌剪刀剪去原离心柱管盖。
室温静止1min,将其放入离心机中8000转离心1min,回收核酸。丢弃离心柱,EP管中即为获取的提取核酸,做好标记与登记。
四、用仪器提取核酸
首先按照说明说准备核酸提取试剂,将200μl灭活样本添加到核酸提取试剂中,根据核酸提取仪的设置程序上机提取核酸,等仪器操作结束,提取核酸完成,回收核酸。
五、PCR体系配置
根据检测样本数量配制体系,将配制好的PCR体系充分混匀并离心后,将其通过传递窗送至样本处理核酸加样区,或单独的样本加样实验室。按照每孔分装20μL反应体系,进行分装,在各孔分别加入5μL待测样本核酸或阴阳对照物(请注意每次检测器包含1个阳性对照和3个阴性对照且阴性对照需随机分布),密封PCR管,有条件时模板加样尽量在单独的生物安全柜进行。
工作人员将配好的PCR管通过传送窗口送至PCR扩增区,或由人送至PCR扩增实验室,上机检测。
六、上机检测及结果分析
工作人员进入基因扩增分析实验室,从传递窗取出PCR反应管,上机前需混匀并离心反应体系,按试剂盒说明说设置扩增参数并分析判读结果。分析结果时,严格阅读说明说充分了解试剂盒灵敏度、方法学局限性等综合判读实验结果。
为防止扩增污染,反应结束后的PCR扩增管严禁开盖并装入密封带中装入的垃圾桶中。
七、检测后的消毒处理
样本处理完成后,工作人员应用75%的酒精消毒处理外层手套并脱下外层手套,放入生物安全柜中的生物垃圾桶中。检测完成后,生物安全柜台面和地面应用0.5-1%的有效氯消毒剂或75%乙醇进行擦拭。将安全柜内产生的医疗垃圾用三层垃圾袋密封,并将其放入垃圾桶中,垃圾袋上需标记医疗垃圾信息。实验结束后,生物安全柜以及实验室均要进行紫外灯照射消毒,时间至少30min。
实验操作人员,应有他人用0.5-1%的有效氯消毒剂或75%乙醇对一次性隔离衣均匀喷雾消毒处理,而后脱去隔离衣将检测医用垃圾放入制定垃圾桶中,工作人员在离开二级实验室后,应在缓冲区或走廊按顺序摘脱个人三级防护用品,首先应带新的外层手套,摘掉护目镜并置于75%乙醇中消毒,自上而下、自内向外翻转脱掉一次性防护服,脱去外层手套,摘除、一次性帽子、脱一次性鞋套。脱掉手套,病毒防护服均需进行高压灭菌处理。高压前后医疗垃圾严格区分。
病毒相关垃圾需在120度,30min条件进行湿热高压处理,以高压试纸条变色为有效,而后作为普通医疗垃圾处理。