为了全面落实全省科技创新大会部署和省“十三五”科技创新规划，我院紧紧围绕淮安市发展需要，以服务地方经济为目标，积极组织后方母校团队申报省市级科技项目，近几年来，我院一共申报立项7个项目。
围绕深入实施创新驱动发展战略、加快建设创新型城市的总体要求，在生物医用材料领域，我院院长赵波教授于2016年9月带领其团队申报了《淮安市生物医药功能材料与分析技术创新服务平台》的项目，该项目对淮安市经济社会发展有一定的促进作用与影响。
        围绕民生科技和社会可持续发展需求，以集成创新与示范为重点，强化技术 应用和问题导向，聚焦生命健康、生态环境、公共安全、智慧城 市、海绵城市等重点领域的创新需求，在食品安全快速检测的领域，我院院长赵波教授于2016年9月带领其团队申报了《畜禽产品中磺胺类抗生素高通量快速检测关键技术研究及应用》的项目，食品安全已经成为我国亟待解决的重大国计民生问题，检测技术是食品安全监管的关键环节，该项目对于丰富和发展我市乃至我国的检测技术，保障百姓健康和贸易安全都有重要意义；在重金属水污染领域，我院陈昌云教授于2016年9月带领其团队申报了《一种用于水中重金属快速检测的便携式分析仪的研发》的项目，该项目对于丰富和发展我国的重金属检测方法具有重要的创新和实际意义，在重金属检测和监督方面具有很大的应用价值。
        围绕“4＋2”优势特色产业及其它战略性新兴产业的培育，在工业及信息化领域，我院毛春教授于2016年9月带领其团队申报了《全血直接检测生物传感器的设计、制备及应用》的项目，该项目在生命分析领域具有重要意义；在现代农业领域，我院薛叶敏教授于2016年9月带领其团队申报了《高效半纤维素酶工程菌创建与秸秆资源化利用研究》的项目，本项目可以综合有效的解决废弃物秸秆焚烧等问题，保护环境，是秸秆“变废为宝”，并能促进农业增收，实现利用秸秆造福社会和国家。
        围绕省基础研究计划（省自然科学基金）的目标要求，在光电化学研究领域，我院屠闻文教授于2016年9月带领其团队申报了《多功能低毒光电化学纳米探针的设计与近红外光激发的高灵敏光电化学生物分析》的项目，该项目的研究将解决以往光电化学检测过程中对生物分子和细胞的伤害，同时也有望提高光电化学检测的灵敏度。
        在《江苏省科技服务业特色基地（淮安智慧谷）科技服务骨干机构能力提升》项目中，我院通过积极争取申报，成为了省创新能力提升计划的科技服务骨干机构，并在此基础上，围绕计划要求，依托后方母校的创新资源，积极做好服务工作，在更大范围和更高层次上提升淮安市科技研发和成果转化的服务水平。
        同时，我院还注重与企业之间的合作研发，我院赵波教授于2016年10月与江苏德诺检测技术有限公司就《环境重金属镉铅的快速检测及前处理方法研发》签订了合作协议；我院童文俊教授于2017年12月与江苏九色鹿电子科技有限公司就《生物活性材料和复杂组分分离纯化技术研究》签订了合作协议；我院黄鹤勇教授与道中道（菏泽）制药有限公司、山东绅联药业有限公司、徐州万邦金桥制药有限公司签订了合作协议。