粪大肠菌群检测仪进行检测的一般步骤：

样品采集与处理：首先，从待检测的水源或其他环境中采集样本。样本可能需要经过一些预处理步骤，如过滤、离心等，以去除干扰物质，提高检测效率。

接种与培养：将处理后的样品接种到特定的培养基中，并在适当的条件下（如恒定的温度和湿度）进行培养。这一步是为了让粪大肠菌群在培养基上生长繁殖。

初发酵与观察：培养一段时间后，对培养基进行初发酵观察。通过观察培养基中菌落的生长情况，可以初步判断样品中是否存在粪大肠菌群。

复发酵与确认：对初发酵阳性的样本进行复发酵试验，以进一步确认粪大肠菌群的存在。这一步骤通常涉及使用更精确的方法或试剂来检测和计数粪大肠菌群。

光度检测与算法处理：如果是基于酶底物法的粪大肠菌群检测仪，还会利用先进的光、机、电技术，通过精密的光度检测来测量酶反应产物的吸光度。然后，结合特定的算法处理，将吸光度转化为对应的菌群浓度。

结果输出与解读：最后，粪大肠菌群检测仪会输出检测结果，通常以数值或图表的形式展示。这些结果可以帮助用户了解水源或其他环境中的粪大肠菌群污染情况，从而采取相应的措施保障环境卫生和食品安全。