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RNA转录组学研究

时间:2023-10-24      阅读:1028

在生命科学领域,RNA转录组学正逐渐成为研究细胞生命活动的重要工具。它可以帮助我们深入了解细胞在特定生理状态下的基因表达模式,为疾病诊断、药物研发和生物医学研究提供有力支持。


一、RNA转录组学的研究对象

RNA转录组学的研究对象包括细胞类型、组织类型、生理状态等。在细胞类型方面,RNA转录组学可以对各种人体细胞进行深入研究,揭示不同细胞之间的基因表达差异。在组织类型方面,RNA转录组学可以分析不同组织中的基因表达谱,揭示组织特异性的基因表达模式。在生理状态方面,RNA转录组学可以研究细胞在不同生理状态下的基因表达变化,如生长、分化、凋亡等。


二、RNA转录组学的研究方法

RNA转录组学的研究方法主要包括高通量测序、表达谱分析、生物信息学处理等。高通量测序技术可以快速、准确地测定基因组的全部转录本,从而获得全面的基因表达信息。表达谱分析则可以对大量基因进行同时检测,揭示基因表达的差异和协同性。生物信息学处理则可以对测序数据进行深入挖掘,解析出基因表达的复杂模式。


三、RNA转录组学的研究应用

RNA转录组学的研究应用广泛,包括功能研究、疾病诊断、药敏测试等。在功能研究方面,RNA转录组学可以帮助我们深入了解基因的功能和作用机制。在疾病诊断方面,RNA转录组学可以识别与疾病相关的关键基因,为疾病的早期诊断和预后预测提供依据。在药敏测试方面,RNA转录组学可以预测药物对细胞的效应,为新药研发和个性化治疗提供支持。


四、RNA转录组学的研究对象主要是转录组,即细胞内所有基因及其表达产物的信使RNA(mRNA)和非编码RNA等。

  1. mRNA:mRNA是基因表达过程中的关键分子,它携带了从DNA转录而来的信息,并进入细胞质中进行翻译,生成具有特定功能的蛋白质。RNA转录组学可以通过对mRNA的研究,揭示基因的表达水平和转录本,从而深入探究生物过程和疾病机理。

  2. 非编码RNA:除了mRNA,RNA转录组学还研究非编码RNA,如微RNA(miRNA)和长非编码RNA(lncRNA)等。这些非编码RNA在基因表达调控中发挥重要作用,可以影响基因转录、翻译和蛋白质功能等。通过对非编码RNA的研究,可以进一步揭示基因表达的复杂性和调控机制。


五、重要研究工具

       PAXgene血液RNA管用于立即稳定细胞内RNA,从而产生准确且可重复的基因表达数据。PAXgene血液RNA管含有一种专有试剂,可在采集后立即稳定细胞内RNA。细胞内RNA在室温下稳定长达三天或在2-8°C下稳定长达五天。PAXgene试管可以在-20°C至-70°C的温度下冷冻,以便长期储存。

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PAXgene血液RNA管特点:

◆ 体外诊断使用,具有CE-IVD标志,符合欧盟98/79/EC 指令

◆ 整合的系统,用于采集、稳定和纯化胞内RNA

◆ 提供在分析工作进行之前的样本标准化处理

◆ 在 18~25℃下,RNA稳定可长达3天

◆ 在-20℃ 或 -70℃条件下至少稳定50个月



参考文献

  1. Friedman, N. et al. (2009). The landscape of the regulatory elements identified by integration of ENCODE with the Catalogue of Somatic Mutations in Cancer (COSMIC). Genome Res 19, 92-104.

  2. Wang, Z. et al. (2018). Single-cell RNA-seq reveals dynamic transcriptional processes during human preimplantation embryo development. Nature 559, 587-591.

  3. Li, H. et al. (2018). Single-cell RNA-seq reveals distinct immune cell populations and activation states in human tissues. Nature Immunology 19, 994-1004.

  4. Zheng, C. et al. (2017). The endothelial transcriptome in human diseases and drug response. Nature Genetics 49, 1373-1382.



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