1.碳源利用变化

　　土壤微生物多样性检测是用了能更加细致地土壤微生物群落的遗传信息，同时也是为了便于研究土壤微生物群落总的遗传能力。而分析方法中的碳源利用变化更有利于寻找微生物成长需要哪些营养成分，因为碳源会根据营养成分的变化而转移。

　　2.聚类分析

　　据相关调查显示近些年分析方法在土壤微生物多样性检测中应用率非常高。特别是聚类分析相当于通过数据建模简化数据的方法集结众多的土壤微生物进行组合分析，同时利用采k-均值、k-中心点等聚类分析工具便于迅速查找同一微生物群体的相似性。

　　3.多样性指数分析

　　许多人对于土壤微生物多样性检测中的多样性指数分析耳熟能详。它可以通过辨识微生物群的种类与个体数的比值，从而获取物种丰富度指数、优势度指数和信息指数，这些指数信息对于验证微生物群体的多样性与稳定性具有非常重大的意义。

　　土壤微生物检测便于获取更多土壤微生物群落多样化更多、更完整的信息，这也是越来越多的土质研究所纷纷寻求好的微生物多样性检测机构的重要原因之一。而这些高品质生物多样性检测机构反馈表示土壤微生物多样性检测分析更适宜选择专业分析方法，并且可从碳源利用变化、聚类分析以及多样性指数分析这几个角度进行分析。