全自动杀菌锅的杀菌工作步骤共有9步，分别为下锅注水、下锅升温、下锅保温、热水回收、冷却注水、冷却循环、冷却排水、锅内排气、工作结束。具体如下：

1、下锅注水。

产品装入下锅内，锅门锁紧并提示报警后，按“杀菌键”（绿色）按钮，系统自行检测上热水罐的压力是否达到上罐的设定压力，若未达到开启“上罐补气阀”，升至上罐设定压力关闭，开启“热水回收阀”及“循环出水阀”，将上罐的热水压进下锅内，当上罐的水位达到低水位或下锅的水位达到高液位时，此步结束转下一工作步骤。

2、下锅升温。

联通阀、循环进水阀、循环出水阀、循环泵、蒸汽阀开启，全自动杀菌锅内压力自动保持设定压力，当达到设定的杀菌温度后，进入保温步（杀菌步）。

3、循环保温。

达到设定杀菌温度后，开始杀菌倒计时，期间温度、压力自控，当达到设定的时间后，进行热水回收步。

4、热水回收步。

联通阀、热水回收阀、循环出水阀、循环泵开启，锅内压力自动控制，当下锅水位达到低水位或上罐达到高水位时，此步结束，转下一工作步。

5、冷却注水。

给水泵、联通阀、给水旁路阀首先开启，当锅内温度降至设定的给水主阀开启温度时，给水主阀打开，注水速度加快，期间压力自控，当水位达到下锅的高水位时，此步结束，转入下一工作步骤。

6、循环冷却。

循环泵运转，循环出水阀循环进水阀开启，期间压力自控，系统自行开始冷却时间倒计时，当达到设定的冷却时间后，此步结束转下一工作步。（若在操作面板的“系统画面”中设定工作在冷却过程中上罐自动加热后，若上罐温度低于设定的温度，上罐自动加热升温）。

7、锅内排水。

排水阀、循环泵打开，将已冷却的循环水用泵排出，直至达到设定的低水位。排水步停止，进入排气步。

8、排气。

排气阀打开排出锅内余气，直至锅内压力为零。

9、工作结束。

系统复位，并发出声光报警，提示操作人员产品杀菌结束。

在使用全自动杀菌锅时，应按照上述步骤进行杀菌，这样不但能保证锅内压力恒定，不会出现冷却涨袋的现象，还能提高杀菌的效率。