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利用超声波DNA打断仪进行NGS建库有哪些优势?

时间:2023-06-05      阅读:942

超声波DNA打断仪,用于把DNA片段切断建库。建库,即文库制备,是指将样本处理成可被测序仪读取的DNA片段,该片段需满足一定的长度,且在两端都连接了指定的序列(锚定序列、测序引物序列、标签序列等)。

超声波DNA打断仪通过压电转换器,将电信号转变为高频声波信号,产生数百万的水分子”空穴”,利用“空穴” 在几微秒内变大、破裂产生的瞬时流体剪切力,通过等温、非接触的方式对样品进行打断、匀浆和混合。


超声法优势在于打断的DNA片段更为集中且无偏好性,是目前NGS建库中片段化的金标准。可在密闭容器、无菌、可超微量条件下进行破碎。相比传统的探头超声波细胞粉碎机,该仪器具有一次可同时检测多个样品、实验效率高、无需频繁操作探头、避免样本交叉污染等优势。仪器标配低温恒温装置(双循环恒温装置),便于样品在4-10℃环境内工 作,使能量分布均匀,超声作用。逐渐成为ChIP(染色质免疫共沉淀)和DNA剪切研究平台必要的标准化工具。

 

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