1、液质联用技术在食品安全分析领域也起着重要的作用。液质联用技术不仅能够定性定量检测禽畜肉和农作物等食品中的药物残留，提供检测物质的结构信息而且精密度高、重现性好，能够排除假阳性检测结果。

  2、液质联用技术在药物分析研究领域也有着重要的意义。在药物研发中的杂质和药代动力学样品的血药浓度的含量很低，分析难度大且干扰多，但液质联用技术由于其选择性强和灵敏度高，可以快速准确地测定药物分析中的痕量物质，且仪器能够对准分子离子进行多级裂解，从而提供化合物的相对分子量以及丰富的碎片信息。

  液质联用仪除了以上的用途，也可以用于药物发现、蛋白质组学、环境和食品安全、临床研究和法医毒理学等领域。