集菌仪的工作原理是利用微孔滤膜过滤的方式，将样品液与集菌器之间进行有效连接。通过微孔滤膜，可以阻隔细菌等微生物，同时保持样品的营养成分。

集菌仪具有自动化程度高、操作简便、集菌效果良好的优点，广泛应用于生物、医药、食品等领域，是进行液体处理和样品分析的重要设备。集菌仪是一种用于微生物实验的仪器，它的应用范围比较广泛，主要包括：

1. 在制药行业，集菌仪主要用于无菌试验，如灌装工艺过程的除泡、集菌等。
2. 在生物、食品行业，集菌仪也可用于微生物实验和产品的无菌检测。
3. 在医院，集菌仪可用于各种注射剂的灌装。
4. 在环保领域，集菌仪也可用于污水处理的污泥浓度控制。

总之，集菌仪是一种重要的实验仪器，在多个领域都有广泛的应用。