分子蒸馏仪也称短程蒸馏仪，是一种在高真空下(残气分子的压力<0.1Pa)进行的连续蒸馏过程的仪器。分子蒸馏过程与传统的蒸馏过程不同，传统蒸馏是在沸点温度下进行分离的，蒸发与冷凝过程是可逆的，液相与汽相间会形成平衡状态。分子蒸馏过程是一个不可逆的，并且在远离物质常压沸点温度下进行的蒸馏过程，更确切地说，它是分子蒸发的过程。（1）分子运动平均自由程。任一分子在运动过程中都在不断变化自由程，在某时间间短程分子蒸馏仪隔内自由程的平均值为平均自由程。设Vm为某一分子的平均速度，f为碰撞频率，λm为平均自由程。则λm=Vm/f，故f=Vm/λm 。（2）分离因数 Langmuir研究了高真空下纯物质的蒸发现象，从理论上推导出纯物质的分子蒸发速率与普通蒸馏相比，分子蒸馏理论分离因数增加了(MB/MA)1/2倍，因此，分子蒸馏技术可以用来分离挥发度相近但分子量不同的混合物系。（3）分子蒸馏技术的基本原理。根据分子运动平均自由程公式知，不同种类的分子，由于其分子有效直径不同，故其平均自由程也不同，即其为不同种类分子。