原子吸收光谱仪的吸收方式主要涉及到原子对光的吸收现象。具体来说，当光源辐射出具有待测元素特征谱线的光通过原子化器时，试样蒸气中的待测元素基态原子会吸收这些特征谱线。原子化器内没有进样时，光通过原子化器没有被吸收，透光率为100%。而当原子化器进样时，光通过原子化器时有一部分被吸收，透光率减小。根据朗伯-比尔定律，吸光度与样品浓度成正比，因此通过测定特征辐射被吸收的大小，就可以求出被测元素的含量。

此外，原子吸收光谱仪的吸收方式还可以根据使用的原子化器类型进行分类。主要有火焰原子吸收光谱法和石墨炉原子吸收光谱法。火焰原子吸收光谱法使用火焰作为原子化器，通过气体燃烧使样品原子化。而石墨炉原子吸收光谱法则利用石墨管产生的高温使样品原子化。这两种方法各有其特点，适用于不同元素的测定。