为此，海南大学三亚南繁研究院/热带农林学院王守创课题组开展了深入研究，并近期在国际学术期刊 Horticultural Research上发表了题为“A metabolomics study in citrus provides insight into bioactive phenylpropanoid metabolism”的研究论文。该研究通过应用基因编辑和分子标记辅助育种技术，加速了优良基因的筛选，并通过代谢组学和基因组学手段解析了柑橘次生代谢物合成途径，为品质改良提供了基础。同时，利用大数据和人工智能优化育种策略，提高了育种效率和精准度。

柑橘作为全球农业经济体系中的核心水果品类，其产业地位无可替代。然而，柑橘类的育种工作却面临着多重艰巨挑战：传统育种方法的低效与周期过长、抗逆性与产量品质难以同步提升，以及由于遗传背景复杂所带来的基因定位困局，这些都极大地阻碍了高品质柑橘品种的培育和推广，进而限制了整个柑橘产业链的持续发展和优化升级。对此，王守创教授领导的科研团队不畏艰难，深入探究柑橘次生代谢物合成路径，以期通过代谢组学和基因组学的双重手段破解品质改良难题。他们展开了一系列精密且全面的研究。

研究团队针对各类柑橘物种展开了全面而详尽的代谢组学分析，对比了不同柑橘品种间的代谢特征，特别关注了它们在酚类丙烷衍生物代谢途径上的变化。研究采用 FaST-LMM 和 EMMAX 方法，通过对 154 个柚子品种进行基于代谢物的全基因组关联分析 (mGWAS)，系统解析了代谢组变异背后的遗传和生化机制。

研究人员进一步构建了柚子的代谢物-单核苷酸多态性-基因交互网络，成功鉴定出多个控制生物活性化合物合成与调节的关键候选基因位点，其中包括参与黄酮糖苷马龙基化的 BAHD 马龙酰基转移酶家族成员。此外，发现了一个名 为CgMYB1 的 R2R3-MYB 转录因子，其对柑橘尤其是柚子中酚类丙烷代谢分子具有显著正向调控作用，尤其影响黄酮类化合物衍生物质的合成。

该研究深入剖析了柑橘中丰富的次生代谢产物，如类黄酮、黄酮醇、类胡萝卜素等对人体健康极其有利的物质合成路径。通过对 CgMYB1 等转录因子的研究，确认了它们对柑橘中酚类化合物生物合成的重要调控作用。该研究不仅丰富了我们对柑橘特别是柚子中复杂黄酮糖苷衍生物生物合成路径的认识，还提供了改善柚子营养价值的潜在目标，并为未来柑橘育种工作提供了一套高效解剖代谢途径的方法。

在研究过程中，为了实现柑橘类样本中代谢物的精准鉴定与量化分析，科研团队采用了 Agilent 液相色谱-四极杆飞行时间质谱（LC-QTOF）技术，对样品进行高分辨率数据采集。得益于此，研究得以高效对比和确认柑橘果实中的各种代谢物信息，从而更深入地揭示柑橘水果内部丰富的生物活性成分，并成功构建了详细的代谢网络。