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一文了解tNGS

时间:2024-11-01      阅读:132

一、tNGS技术原理

tNGS是一种基于超多重PCR扩增(或靶向捕获)与高通量测序两种技术结合的新一代测序技术。它使用大量针对特定基因序列的引物/探针对待测样品中抽提出的核酸进行超多重PCR扩增/探针捕获,获得大量目标核酸片段,再对这些目标核酸片段进行高通量测序,然后对所得序列进行生物信息学分析,从而实现对待测样本中的核酸进行高灵敏以及高分辨率的识别。

二、tNGS优点

1. 针对性强:tNGS只针对特定基因序列进行测序,因此可以大大减少测序数据量,提高检测效率和准确性。

2. 高灵敏度:由于tNGS可以对低浓度的病原微生物进行检测,因此具有高灵敏度。

3. 高分辨率:tNGS能够实现对病原体特定基因的高分辨率识别,有助于精准诊断。

4. 成本低:与mNGS相比,tNGS的测序数据量更少,因此成本更低。

三、tNGS缺点

1. 漏检非靶向基因tNGS技术只能检测预设的目标序列,无法检测非预设的病原体。

2. ‌文库制备复杂:文库制备过程需要更多的时间和试剂,且操作较为复杂。

四、tNGS应用场景

1. 感染性疾病诊断tNGS技术能够快速、准确地检测临床样本中的多种病原微生物,特别是对低浓度的病原微生物及其毒力和耐药基因的检测具有显著优势。这种方法不依赖于传统的微生物培养,直接对样本中的几十种至几百种已知病原微生物及其毒力和/或耐药基因进行富集,再进行高通量测序,然后与数据库进行比对分析,从而提供客观的诊断依据

2. 耐药结核病检测tNGS技术在耐药结核病检测中表现出色。世界卫生组织(WHO)发布的报告指出,tNGS技术能够有效检测结核分枝杆菌的耐药性,具有较高的诊断准确性和成本效益。尽管传统分子诊断技术已广泛应用,但tNGS技术提供了更全面的检测范围,解决了部分药物检测的盲区,特别是在多耐药结核病的判定上具有显著优势


3.‌呼吸道病原体检测tNGS技术也被应用于呼吸道病原体的检测。例如,精准分子医学中心开展的呼吸道病原体靶向测序(tNGS)检测项目,能够覆盖常见的呼吸道病原微生物,包括细菌、病毒、真菌等,辅助指导临床用药。该技术不仅提高了诊断的准确性,还提供了耐药基因的检测报告,有助于精准治疗。


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