RNA 的提取和纯化实验
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1. 缓冲液、溶液和试剂
氯仿
焦碳酸二乙酯(DEPC) 处理过的 H20(GenHimterR105)
乙醇
70% 乙醇洗液(用 DEPC 处理过的 H20 配制)
异丙醇
苯酚-胍盐单相溶液(推荐 RNApure,GenHunterP501-P503)
磷酸盐缓冲液(PBS)
2. 离心机和转头
小离心机
3. 专用设备
50 ml 锥形管
1.5 ml 小离心管
1000ul(原文为 ml。—译者改)移液器
100~150 mm 平板
P10 移液器
Pdytron 匀浆器(用于从组织中提取 RNA)
步骤
一、RNA 提取
方法 1: 从组织培养物中提取 RNA
1. 如果细胞贴在瓶壁或平板上,则倒掉培养基,将平板置于冰上。
2. 如果细胞是悬浮的,旋转离下细胞,并除去培养基。
3. 用 10~20 ml 的冷磷酸盐缓冲液(PBS) 漂洗细胞。
4. 倒掉 PBS,并用 1000ul 移液器吸去残留的 PBS。
5. 每 100~150 mm 平板加入 2 ml 苯酚-胍盐单相溶液(RNApure),以裂解细胞(摇晃平板使溶液分布均匀)。这个体积足够裂解 100 万~1000 万个细胞。
6. 将平板放在冰上 10 min。
7. 将裂解液吸到两个标记好的 1.5 ml 离心管中。
方法 2: 从组织中提取 RNA
1. 在装有组织的 50 ml 锥形管中,加入至少 2 ml 苯酚-胍盐单相溶液(RNApure), 并置于冰上。组织和酚溶液的理想比例至少应该是 1:10。
2. 用 Polytron 匀浆器将组织搅匀,直到组织wan全分散为止。
3. 将管子置于冰上10min。
4. 取 1ml 裂解液,分装到标记好的 1.5 ml 离心管中。
方法 3: 从血液中提取 RNA
1. 将血液产品离心,并除去血浆。
2. 按照上面从组织中提取 RNA 的说明逬行操作。
二、RNA 的纯化
1. 每毫升裂解液加入 150ul 氯仿,涡旋混匀 10min。
本方案可以在此处停止,并将裂解液放置在-80°C
2. 在 4°C 以最大转速离心 10min。
3. 小心地将上清液转移到一个干净的、标记好的 1.5 ml 离心管中。
4. 加入等体积的异丙醇,并在冰上放置 10min,然后剧烈地混匀或涡旋混匀 30s。
5. 将混合物在 4°C 以最大转速离心 10min。
6. 用 1ml 预冷的 70% 乙醇(用 DEPC 处理过的 H20 配制)洗涤 RNA 沉淀,在 4°C最大转速离心 2 min。
7. 倒掉乙醇。短暂离心后,用移液器吸去残留的洗液。
8. 将 RNA 在 5ulDEPC 处理过的 H20 中重新悬浮。
注意:如果 RNA 用于任何扩增反应,悬浮液中不要使用 SDS。
9. 取1ul RNA(用 P10 移液器)测定浓度,用1ml H20 稀释。在 260nm 下读数,注意 1OD260=40ug。
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