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PCR微流控芯片»»»分子POCT

时间:2022-07-21      阅读:584

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聚合酶链式反应(PCR)

聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)技术是实现将低浓度的DNA样品进行化学放大扩增的过程,该方法在数小时内可使几个拷贝的模板序列甚至一个DNA分子扩增107~108倍,操作简便,现已广泛应用到分子生物学研究的各个领域,其核心是DNA的半保留复制。


PCR技术主要分为三个阶段:

(1)DNA变性。在92~97℃下加热双链结构的DNA样品,使链间的氢键发生断裂,分解为两条单链的分子。

(2)退火。迅速降低温度到55~65℃,此时单链DNA与引物按照碱基配对的原则互补结合。

(3)延伸。把温度升到72℃左右进行DNA的延伸反应。

每一循环经过变性、退火和延伸,DNA含量即增加一倍。在PCR反应中,温度的变化对DNA复制效率起着决定性作用:升温、降温过程越快,反应所需时间越短。



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分子POCT产品

想必大家都还记得Visby Medical Test这款家庭自检卡盒,款不需要设备的PCR试剂(实际上是把设备做进了卡盒里,其具有诸多优点:小巧、便携、易于操作等,但就是有点儿贵。
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从图中可以看到产品的内部结构,红色箭头所指的便是今天分享的主题。


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Visby家庭自检卡盒的扩增模块便是“PCR微流控芯片”,更准确的应该称为连续流PCR微流控芯片,借助于“空间与时间转换”的方式,通过驱动混合试样通过不同的温度区来实现反应过程。


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Visby家庭自检卡盒的成功,无不得益于微流控技术的使用。”


微流芯片的热容小,比表面积大,传热效率相比宏观PCR装置高很多,因此能利用快速升温降温过程,实现DNA的快速放大,其优势不仅可以节约样品消耗量,而且有利于提高检测的效率及检测的灵敏度,实现便携化检测。


所有反应都需要在液体环境下完成,并且涉及温度的精确控制,因此微尺度的流动问题及传热问题在PCR系统中显得格外重要(需要指出的是,除了三步PCR反应,也存在两步反应,即可将退火和延伸合并为一步,Visb家庭自检卡盒就是两步反应)。


PCR微流控芯片按照结构的不同可分为微室PCR(micro-chamber PCR)连续流PCR(continuous-PCR)两种基本模式。两者的不同之处在于:

(1)微室PCR温度的变化发生在固定容积内,温度变化是通过外界进行动态控制;

(2)连续流PCR通过液体流过具有不同温度分布的位置来实现温度的被动切换。



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微室PCR微流控芯片


优点:具有较小的体积,易于实现多功能集成。

缺点:在冷却速率方面受制于芯片本身的热容,同时微室PCR微流控芯片在结构上有较大的“死体积”,微流控芯片清洗困难,通常仅可使用一次,不适合连续性进行多个试剂的扩增反应。


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连续流PCR微流控芯


优点:连续流PCR微流控芯片借助于“空间与时间转换”的方式,通过驱动混合试样通过不同的温度区来实现反应过程。由于连续流PCR微流控芯片主要依靠微通道实现反应,有比较小的流体“死体积”,运用适当的介质缓冲液进行间隔和冲洗,可以避免不同试样间的交叉污染,使连续流PCR微流控芯片可以实现多个试样连续进样和批量化处理,因而具有“在线(on-site)化学放大器”的功能。

缺点:连续流PCR微流控芯片的不足之处在于,扩增的次数取决于通三个温区的次数,一旦流道设计方案确定,这个循环不能再改变。

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一些新兴的技术可以克服上述两种系统的不足,例如,研究证实,可在室PCR微流控芯片的液体介质中加入金属纳米粒子,同构微波对金属粒子加热,从而对整个流体介质进行加热,具有加热效率高,控制方式灵活的特点。


微流控PCR器件的温度控制方法多样。Krishnan等设计了利用瑞利-伯纳德对流效应的微尺度PCR反应器,其结构如下图所示。


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基于瑞利-伯纳德对流效应的微尺度PCR反应器




该装置在微反应器底部用热板加热到97℃,顶部采用水冷板保持61℃,由于温度差在微反应器内将产生浮力对流,在特定条件下能形成稳定的瑞利-伯纳德对流,溶液中的DNA分子和其他反应组分随着流动在97℃和61℃温度之间循环运动,从而完成DNA的两步PCR扩增。此装置可以通过改变中间反应容器的几何尺寸来改变流动模式。


Hu等利用PCR扩增溶液电导率高的特性,通过不同强度电场产生不同的焦耳热,实现了微通道中的温度控制,从而完成DNA的PCR扩增。


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PCR装置在变性、退火/延伸步骤中的温度分布



参考文献:

[1] Guoqing Hu, Qing Xiang, Rachel Fu, Bo Xu, Roberto Venditti, Dongqing Li. (2006). Electrokinetically controlled real-time polymerase chain reaction in microchannel using Joule heating effect. Analytica Chimica Acta, 557, 146-151.

[2] Madhavi Krishnan, Victor M. Ugaz, Mark A. Burns. (2002). PCR in a Rayleigh-Benard Convection Cell. Science, 298, 793.


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