新型冠状病毒系列解决方案二:粪便及环境水体类样本病毒提取方法汇总
时间:2020-02-10 阅读:2436
对于粪-口传播,除了病患的排泄物及呕吐物还需注意环境水源中的污染检测及控制。针对这类样本的核酸检测,其主要难点在于粪便及环境废水中存在的各类高浓度抑制剂,如果在核酸提取过程中没有*去除会导致下游检测的假阴性风险,延误病毒的发现。
I
粪便&环境水体类样本处理方法汇总
TissueRuptor
TissueLyser LT
TissueLyser II
研磨珠
2×10ml 研磨钢罐T
2×24 2ml 适配器
使用匀浆器TissueRuptor(货号9001272)或高通量组织研磨器TissueLyser II( 货号85300) 可以实现各种组织、细菌、酵母等样品的快速破碎和均质化。TissueRuptor 处理单个样品快至30 秒,TissueLyser 在2-4分钟可处理192个样品。
TissueRuptor TissueLyser LT&TissueLyser样本破碎系统:
TissueRuptor 是一款单通道的手持式电动匀浆器,使用一次性钻头,可对动物及人细胞或组织进行快速、高效的破碎和匀浆。
TissueLyser LT是一款中低通量的研磨器,一次可在几分钟内处理12个新鲜或冰冻样本,TissueLyser II 是一款中到高通量的研磨器,一次可处理2×24 或2×96个样本,可在5 分钟以内完成,TissueLyser 系列适合各种动物组织、植物、酵母或细菌样本。
一次性钻头有效降低交叉污染
快速、高效地破碎各类生物样本
与QIAGEN 样本纯化技术无缝整合
可重复的、标准化的样本破碎
产品 | 说明 | 货号 |
Vortex Adapter for 24 (1.5–2.0 ml) tubes | 24 孔 (1.5–2 ml) Tubes | 13000-V1-24 |
Vortex Adapter for 6 (5 ml) tubes | 6 孔 (5.0 ml) Tubes | 13000-V1-5 |
Vortex Adapter for 4 (15 ml) tubes | 4 孔 (15 ml) Tubes | 13000-V1-15 |
Vortex Adapter for 2 (50 ml) tubes | 2 孔 (50 ml) Tubes | 13000-V1-50 |
TissueLyser II | 研磨仪 | 85300 |
TissueLyser Adapter Set 2×24 | Tissuelyser 适配器2×24 | 69982 |
TissueLyser Adapter Set 2×96 | Tissuelyser 适配器2×96 | 69984 |
II
粪便&环境水体类样本处理方法汇总
01
RNeasy PowerMicrobiome Kit(50)货号:26000-50
• 可从多至250mg粪便样本中提取微生物总RNA。包含抑制因子去除zhuan利技术,可*去除粪便样本中各类复杂高浓度抑制剂。包含柱上DNase消化过程,获得不含gDNA污染的总RNA。*包含2ml珠磨研磨管,搭配PowerLyzer 24(货号:13155),30秒或涡旋振荡仪匹配Vortex Adapter for 24(1.5-2.0 ml) tubes (货号:13000-v1-24)10-20分钟可获得*裂解效果。可在QIAcube Connect(货号:9002864)上自动纯化。从血浆、血清和无细胞体液中同时纯化毒 DNA 和 RNA,无需有机提取或乙醇沉淀,*去除污染物和抑制剂。起始样品体积可多至 0.2 ml,使用选择性结合的硅胶膜,具有 20–150μl 的灵活洗脱体积。表格中列出的试剂盒除了可以灵活的手工操作外,均可以在 QIAcube 全自动核酸纯化仪上实现自动化操作。
02
Allprep PowerViral DNA/RNA Kit(50) 货号:28000-50
• 可从多至250mg粪便、肠容物样本或200ul废水或拭子样本中提取所有病毒DNA和RNA。包含抑制因子去除zhuan利技术,可*去除样本中高浓度抑制剂。*包含2ml珠磨研磨管,搭配PowerLyzer 24(货号:13155),30秒或涡旋振荡仪匹配Vortex Adapter for 24(1.5-2.0 ml) tubes (货号:13000-v1-24)10-20分钟可获得*裂解效果。
03
RNeasy PowerWater Kit(50) 货号:14700-50-NF
• 可从一张47mm水体滤膜或25mm空气滤膜中提取微生物总RNA。无需剪碎滤膜,避免额外接触引入交叉污染。包含抑制因子去除zhuan利技术,可*去除样本中高浓度抑制剂。*包含5ml珠磨研磨管,搭配涡旋振荡仪匹配Vortex Adapter for 6(5 /15 ml) tubes (货号:13000-v1-5)10-20分钟可获得*裂解效果。
III
病毒定性检测(有效提升阳性筛查率)
QuantiNova Pathogen +IC Kit (100/500) 货号:(208652/ 208654)
• 凯杰208652内置Internal Control(IC),帮助监控提取及PCR效果,助力疫情筛查出真阳性!
• 内置合成的转录本,可以非常好的监控从提取,反转录到荧光定量的整个环节,确保每个环节都精准可控
• 通过内置颜色指示剂实现准确的反应构建,避免重复或者漏加样