水中的氮、磷污染主要表现为水体富营养化。水体中氮、磷含量与富营养化程度密切相关，一般来说，水体中总磷和总氮分别超过0.05mg/L和1.0mg/L，就认为水体处于轻度富营养化状态。水体维持较高的氮、磷总量，主要是由种植业施用的氮磷肥、农业废弃物、生活污水和造纸、制革、印染、食品等工业废水大量排入水体引起的。另外，对于富营养化湖库、海湾等缓流水体，沉积物内源氮、磷的释放也是水体氮、磷的重要来源之一，造成富营养化、藻类水华形成。

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 磷是引起水体富营养的根源，虽然城市污水的磷含量很低，但是其排放水量极大。如未经处理直接排除水体，将会严重污染水环境。