qPCR的核心数据是Ct值，而荧光信号是Ct值计算的数据来源，所以管内的荧光能否完好地传递至检测器是至关重要的。白色的管壁能够阻止荧光穿过管壁和折射，进而防止荧光传至加热模块，也就是放管子的金属孔壁，透明管会导致荧光被模块吸收或发生不一致反射等情况。因此相比于透明管，使用白管能较为有效地避免信号干扰，从而采集到更强、更聚焦的荧光信号。

PCR板的裙边指的是板周围的延伸部分。常见的有无裙边、半裙边和全裙边三种。无裙边能够通配所有机型，而全裙边PCR板通常用在自动化工作站中。裙边作用是在构建反应体系时为移液过程提供稳定性支撑，以及在结合自动化工作站时提供机械强度和抓手。