液质联用仪主要应用于药物代谢及药物动力学研究、临床药理学研究、天然药物（中草药等）开发研究、新生儿筛选、蛋白与肽类的鉴定、残留分析、毒物分析、环境分析－*、环保、食品、自来水、卫生防疫等行业。液质联用仪的灵敏度高，通量性能好——优异的高流量性能、降低的离子抑制效应、自清洁离子源探针设计和可靠的接口设计，加速了分析速度；使用更简便。
液质联用仪的主要技术指标：
液相系统的流量范围：0.01-100μl/min；
柱精度<0.7%RSD；组分精度<0.2%RSD；
进样量0.01-40 μl 精度<3%RSD；
质量范围：13000Da；
分辨率：>5000FWHM 。
液质联用仪主要用途：
该仪器适用于常量，微量，痕量的药物及其代谢物的质量测定，结构确证，及多肽，蛋白质，核苷酸，多糖等生物大分子聚合物的序列分析。相对于一般的低分辨率LC-MS，该仪器具有进样量更小（nl级），灵敏度更高（fmol级）质量范围更大（13000Da），分辨率更高（>5000FWHM），且可提供更多结构信息等特点。