实验室级别的制备液相色谱主要用于以下领域：

1.天然药物化学、中药化学。这是国内目前较为广泛的使用方法，为了弄清楚植物中的微量有效成分，开放手工色谱柱早已不够用了，几乎每个搞天然药化的实验室都至少有一台液相。

2.蛋白纯化。相对于前者，蛋白纯化的起步要稍微晚一点，但是发展很迅速。同时，由于外国仪器厂家在这个领域的优势不算太大，目前国内也在这个领域加快发展，抢占地盘。

3.药物杂质纯化。由于合成工艺并不能做到100%的产率，往往伴有副产品，如何获得微量的杂质并确定结构和含量，这就得靠液相色谱。

4.手性化合物的制备。这个主要是有机合成和方法学的在用。

总之，目前有机化学领域里，开放手工柱层析依然是常用的分离手段，也是每个实验员必会的技能之一，其在未来很长一段时间里将仍然扮演重要的角色。制备液相已经在天然药化领域大面积使用，在将来，随着科研的需要和价格的下降，将会逐渐进入千家万户。