在实验室里，用于制备的液相，配置和普通的分析液相差不多。有泵，有进样器，有柱子，有检测器。为了收集分离出来的化合物，制备液相通常还配一个馏分收集器。

　　馏分收集器就像液相色谱的收纳盒，把每次分析的同类物质收纳到一起。馏分收集器可以直接串联在检测器后面。也可以连接一个三通，和检测器并联，都接在色谱柱的后面。有些实验室里需要收集的量，一个馏分收集器装不完，还可以并联好几个。根据检测器的信号显示，当化合物出峰的时候，仪器会自动收集。一般按照时间编程，也可以根据检测器的信号度自动触发。一个个化合物通过馏分收集器收集到小瓶或者试管里，也可以通过管路连接到更大的瓶子。

　　目前，实验室级别的制备液相色谱主要用于以下领域：

　　1.天然药物化学、中药化学。这是国内目前的使用方法，为了弄清楚植物中的微量成分，开放手工色谱柱早已不够用了，几乎每个搞天然药化的实验室都至少有一台液相，土豪实验室人手一台液相。

　　2.蛋白纯化。相对于前者，蛋白纯化的起步要稍微晚一点，但是发展迅速。同时，由于外国仪器厂家在这个领域的势不算太大，目前国内也在这个领域加快发展，抢占地盘。

　　3.药物杂质纯化。由于合成工艺并不能做到100%的产率，往往伴有副产品，如何获得微量的杂质并确定结构和含量，这就得靠液相色谱。

　　4.手性化合物的制备。这个主要是有机合成和方法学的在用。

　　总之，目前有机化学领域里，开放手工柱层析依然是常用的分离手段，也是每个有机狗必会的技能之一，其在未来长一段时间里将仍然扮演重要的角色。制备液相已经在天然药化领域大面积使用，在将来，随着科研的需要和价格的下降，将会逐渐进入千家万户，终跟旋蒸一样普及。