仪器稳定性：氪氙色谱分析仪需要一定的时间才能达到稳定状态。例如，某些型号的仪器开机稳定时间可能小于1小时。在仪器稳定之前进行样品分析可能会导致结果不准确。

温度控制：色谱分析仪中的温度设置对分析结果有很大影响。柱温和程序升温都需要精确控制，控温精度通常要求达到≤±0.1℃。不适当的温度可能导致样品分解或色谱峰变形，从而影响分析准确性。

检测器灵敏度：氪氙色谱分析仪的检测器具有高灵敏度，因此需要使用高纯度的载气，并且载气、氢气及空气应经过净化器净化，以避免杂质干扰。同时，高灵敏度也要求操作人员在处理样品时要特别小心，以避免对检测器造成污染或损坏。

基线噪声和基线漂移：这些参数是评价色谱仪性能的重要指标。基线噪声和基线漂移越小，说明仪器的稳定性越好，分析结果的可靠性越高。

定量重复性：定量重复性好的色谱仪能够在多次测量同一样品时得到一致的结果。这对于需要频繁进行样品分析的实验室来说尤为重要。

维护和保养：定期对色谱仪进行维护，如清洁系统组件、更换老化零件和校准仪器等，是确保仪器长期稳定性和准确性的关键。忽视维护和保养可能导致仪器性能下降，甚至损坏。