1、管路接头易腐蚀损坏。SMC-9021型CEMS系统配置的管接头、总排气管、排水桶盖、露点测量杯均是采用尼龙材料，尼龙材料在酸性环境下使用，会出现腐蚀导致渗漏，从而直接影响系统运行和设备损坏。
改进方法：更换所有尼龙采材的管接件，全部更换为稀氟材料和管接件即可解决。
2、采样和反吹相结合部位出现积水导致不锈钢管腐蚀漏气。从采样探头的保温到管路连接至仪器柜都有较好的保温，探头在130℃，管路全程在100℃，采样阀反吹阀也都安装在100℃左右的恒温箱之内，但是在采样管进入仪表柜到采样/反吹阀之间段没有任何保温措施，采样气体由100℃变到室温20℃左右，温度的突然下降就在管路内形成了凝结水；而采样阀安装在上方反吹阀安装下方导致阀前反吹管中形成积水死区，每次反吹又将积水吹入采样管内，长期以往积水的含硫量很大且长期腐蚀导致不锈钢管腐蚀漏气。
改进方法：将采样阀和反吹阀安装位置更换（反吹阀在上方，取样阀在下方），柜内取样管路至冷凝器从高到低放置；做好取样阀前柜内取样管的保温工作。
3、气体冷凝器效率低和易渗漏。气体冷凝器的作用是降低样气中的露点，快速冷凝除去样气中的水份,从根本上避免了潮湿样气中腐蚀性气体结露对分析仪表的损坏，SMC-9021型CEMS系统配置的样气冷凝器是SMB-206型压缩机式冷凝干燥器，采用压缩机式冷却和铜管进行热交换原理，效率低是指该冷凝器用在含硫量较低的净烟气测量中脱水效果还可以，但用在含硫量较高的原烟气测量中则不能把水处除于净，从而导致潮湿样气中腐蚀性气体结露对分析仪表测量腔室的损坏；易渗漏指铜管交换器在使用中被SO2与水形成的硫酸腐蚀损坏而造成渗漏。
改进方法：采用德国产Bühler EGK 1/2气体冷凝器替代SMB-206型压缩机式冷凝干燥器， Bühler EGK 1/2气体冷凝器采用是的电子冷却和合金玻璃材质双流热交换器原理，使用效果好并不易渗漏。
4、系统管路漏气。漏气点出现在采样泵前会导致空气进入，直接影响烟气测量参数准确性；烟气漏气点出现在采样泵后会影响烟气流量的调整以及使烟气排放在测量控制柜内和房间，长期积累的烟气会对设备形成腐蚀以及维护人员的身体建康形成直接的影响。
改进方法：定期检查管路接头，试验烟气管路的严密性，并检查是否有管路因腐蚀而泄露，定期检查和更换排水蠕动泵泵管，检查采样探头是否存在漏气，检查反吹气阀门关闭是否严密。管路漏气虽然是故障比较多，但是经过逐级排除检查，就能排除故障。
5、流量异常，主要是指流量偏低，无流量或大范围晃动。
造成流量异常的情况主要有管路堵塞，接头泄漏，采样泵泵膜损坏，流量计脏污等。管路堵塞主要为有水以及灰尘等使管路阻力增大，流量降低，冷凝瓶温度低结冰也会造成堵塞，应定期检查保持管路通畅。接头泄露引起流量变化的主要是在采样泵以后的管路，容易使流量明显降低，蠕动泵泵管破裂也会造成流量有节奏的波动及参数大幅变化，紧固接头或更换泵管会很快消除故障。采样泵膜片破损也会造成泵的出力下降，流量降低或规律性波动，更换膜片后流量应正常。流量计脏污则使浮球卡涩，显示的流量不能正确反映进入分析仪表的流量，影响测量的准确度，应进行流量计的清洁，使之正确显示。
6、颗粒物测量元件故障。
颗粒物测量元件容易脏污，有水，光线偏移。测量原件镜头长期在恶劣的条件下运行，镜头很容易沾染污物，降低测量准确度，应定期检查清洁。有水则是由压缩空气在清洁镜头时，烟道内外温差较大，气候变化剧烈时容易形成凝结水珠影响光线的直射和反射，影响测量，定期检查和排水是非常重要的。激光光线的偏移则是由现场环境的振动，温差变化产生热胀冷缩使相对位置偏移造成的，经常检查光点的对准情况，及时校正。颗粒物测量是维护量相对较大的测量设备，应提高定期检查维护的质量，保证良好的测量环境，使测量系统准确测量，正常运转。
除此之外，CEMS系统的外围设备如压缩机，取样探头，压力温度变送器都要进行定期检查，CEMS系统的软件也要定期维护，确保GPRS通讯设备正常工作，存储系统测量原始数据，形成日报表，月报表和年报表，检查处理出现的报警故障信号，保障监控系统正常工作。
