如果对加热温度控制要求比较严格时，就得选择集热式水浴磁力搅拌器或浸水式磁驱搅拌器了，水浴型相当于标准型加热式磁力搅拌器的底盘上集成了一个水浴锅，而水浴加热具有传热均匀、控温精、加热安的特点，因此水浴集热式磁力搅拌器适用于控温要求严格以及容器底部不平(如烧瓶)等难以从加热底盘受热的应用场合，或者直接选用浸水式搅拌器放入水浴中进行搅拌作业；
水浴磁力搅拌器利用了磁场和漩涡的原理将液体放入容器中后，将搅拌子同时放入液体，当底座产生磁场后，带动搅拌子成圆周循环运动从而达到搅拌液体的目的。配合温度控制装置，可以根据具体的实验要求控制并维持样本温度，帮助实验者设定实验条件，大的提了实验重复性的可能。适用于搅拌或加热搅拌同时进行，适用于粘稠度不是很大的液体或者固液混合物。
水浴磁力搅拌器工作的过程中，还需要精显示实时转速，就选择数显转速加热式磁力搅拌器，不过带有这种显速功能将使仪器的价格大幅提，常州高德仪器制造有限公司建议要求苛刻的研究级场合选使用；如果搅拌的液体容量较多，需选择大容量磁力搅拌器，常规磁力搅拌器的搅拌容量一般2000mL以下。
