实验室用超声波清洗器：主要用于生物化学、微生物学、药物学、物理学、动物学、农学、医学、食品、制药等行业的实验分析或实验器具的清洗，还广泛应用电子、光学、机械、汽车、电镀、液压、珠宝首饰等待业的破碎、乳化、分散、助溶、提纯、消泡脱气、加速化学反应等。
汽车行业超声波清洗器：主要用于清洗气门、点火栓、燃料泵、油箱、蓄电池电极、活塞环、机器操纵盘零件上的油脂、防腐剂、塑料残留物、研磨磨料、石墨等。
医用超声波清洗器：超声波清洗机用于医疗行业可以*清洗手术机械及手术附件的各种污渍，排出人工清洗不*的问题，所以卫生部公布《内镜清洗消毒技术操作规范》，在规范中规定：“内镜及附件用后应当立即清洗、消毒或灭菌…需在超声波清洗机内清洗5--10分钟。"和采用戊二醛、环氧乙烷浸泡消毒、灭菌。在《医疗机构口腔诊疗器械消毒技术操作规范》中规定：牙科器械“应当采用超声清洗"和采用环氧乙烷、戊二醛浸泡消毒、灭菌。
电子行业超声波清洗器：PCB电路板的清洗。我国电子行业中，绝大多数企业都在使用PCB，PCB组件焊接采用的助焊剂分为水溶型、松香型和免清洗型三类，使用较多的为前两种，多采用超声波清洗(也有不少是采用酒精刷洗)，免清洗型原则上应该不清洗，但是，目前世界各国的大多数厂家即使采用免清洗型焊剂焊接组件，仍需要清洗。特别是高密度PCB以及高密度IC出脚不清洗或不采用超声波清洗，必将导致高密度线路之间和IC出脚之间吸附尘埃，一旦环境湿度大，极易发生高密度线间和脚间短路而出现故障，而一旦环境干燥，短路故障又自行消失，这类故障又不易查找。所以世界各国的电子整机厂均坚持对PCB板作超声波清洗。在我国，军工电子整机厂已开始推广，并收到了因此举既提高了产品可靠性，又降低了售后服务成本的双重效益。
