原理
倒置显微镜和放大镜起着同样的作用，就是把近处的微小物体成一放大的像，以供人眼观察。只是显微镜比放大镜可以具有更高的放大率而已。
物体位于物镜前方，离开物镜的距离大于物镜的焦距，但小于两倍物镜焦距。所以，它经物镜以后，必然形成一个倒立的放大的实像A'B'。A'B'靠近F2的位置上。再经目镜放大为虚像A''B''后供眼睛观察。目镜的作用与放大镜一样。所不同的只是眼睛通过目镜所看到的不是物体本身，而是物体被物镜所成的已经放大了一次的像。
结构
倒置显微镜的构造主要分为三部分:机械部分、照明部分和光学部分。
机械部分
⑴镜座:是显微镜的底座，用以支持整个镜体。
⑵镜柱:是镜座上面直立的部分，用以连接镜座和镜臂。
⑶镜臂:一端连于镜柱，一端连于镜筒，是取放显微镜时手握部位。
⑷镜筒:连在镜臂的前上方，镜筒上端装有目镜，下端装有物镜转换器。
⑸物镜转换器(旋转器):接于棱镜壳的下方，可自由转动，盘上有3-4个圆孔，是安装物镜部位，转动转换器，可以调换不同倍数的物镜，当听到碰叩声时，方可进行观察，此时物镜光轴恰好对准通光孔中心，光路接通。
⑹镜台(载物台):在镜筒下方，形状有方、圆两种，用以放置玻片标本，中央有一通光孔，我们所用的显微镜其镜台上装有玻片标本推进器(推片器)，推进器左侧有弹簧夹，用以夹持玻片标本，镜台下有推进器调节轮，可使玻片标本作左右、前后方向的移动。
⑺调节器:是装在镜柱上的大小两种螺旋，调节时使镜台作上下方向的移动。
①粗调节器(粗螺旋):大螺旋称粗调节器，移动时可使镜台作快速和较大幅度的升降，所以能迅速调节物镜和标本之间的距离使物象呈现于视野中，通常在使用低倍镜时，先用粗调节器迅速找到物象。
②细调节器(细螺旋):小螺旋称细调节器，移动时可使镜台缓慢地升降，多在运用高倍镜时使用，从而得到更清晰的物象，并借以观察标本的不同层次和不同深度的结构。
照明部分
装在镜台下方，包括反光镜，集光器。
⑴反光镜:装在镜座上面，可向任意方向转动，它有平、凹两面，其作用是将光源光线反射到聚光器上，再经通光孔照明标本，凹面镜聚光作用强，适于光线较弱的时候使用，平面镜聚光作用弱，适于光线较强时使用。
⑵集光器(聚光器)位于镜台下方的集光器架上，由聚光镜和光圈组成，其作用是把光线集中到所要观察的标本上。
①聚光镜:由一片或数片透镜组成，起汇聚光线的作用，加强对标本的照明，并使光线射入物镜内，镜柱旁有一调节螺旋，转动它可升降聚光器，以调节视野中光亮度的强弱。
②光圈(虹彩光圈):在聚光镜下方，由十几张金属薄片组成，其外侧伸出一柄，推动它可调节其开孔的大小，以调节光量。
光学部分
⑴目镜:装在镜筒的上端，通常备有2-3个，上面刻有5×、10×或15×符号以表示其放大倍数，一般装的是10×的目镜。
⑵物镜:装在镜筒下端的旋转器上，一般有3-4个物镜，其中zui短的刻有"10×"符号的为低倍镜，较长的刻有"40×"符号的为高倍镜，zui长的刻有"100×"符号的为油镜，此外，在高倍镜和油镜上还常加有一圈不同颜色的线，以示区别。
显微镜的放大倍数是物镜的放大倍数与目镜的放大倍数的乘积，如物镜为10×，目镜为10×，其放大倍数就为10×10=100。
操作步骤
⒈倒置显微镜中zui常用的观察方法就是相差。由于这种方法不要求染色，是观察活细胞和微生物的理想方法。在此提供各种聚光器来满足需要，这种方法提供带有自然背景色的、高对比度的、高清晰度的图像。
⒉开机。接连电源。打开镜体下端的电控开关。
⒊使用
⑴准备:将待观察对象置于载物台上。旋转三孔转换器，选择较小的物镜。观察，并调节铰链式双目目镜，舒适为宜。
⑵调节光源:推拉调节镜体下端的亮度调节器至适宜。通过调节聚光镜下面的光柵来调节光源的大小。
⑶调节像距:转三孔转换器，选择合适倍数的物镜;更换并选择合适的目镜;同时调节升降， 以消除或减小图像周围的光晕，提高了图像的衬度。
⑷观察:通过目镜进行观察结果;调整载物台，选择观察视野。
⒋关机
取下观察对象，推拉光源亮度调节器至zui暗。关闭镜体下端的开关，并断开电源。旋转三孔转换器，使物镜镜片置于载物台下侧，防止灰尘的沉降。
注意事项
⒈所有镜头表面必须保持清洁，落在镜头表面的灰尘，可用吸耳球吹去，也可用 软毛刷轻轻的掸去掉。
⒉当镜头表面沾有油污或指纹时，可用脱脂棉蘸少许无水乙醇和YM的混合液(3:7)轻轻擦拭。
⒊不能用有机溶液清擦其它部件表面，特别是塑料零件，可用软布蘸少量中性洗涤剂清擦。
⒋在任何情况下操作人员不能用棉团、干布块或干镜头纸擦试镜头表面，否则会刮伤镜头表面，严重损坏镜头，也不要用水擦试镜头，这样会在镜头表面残留一些 水迹，因而可能滋生霉菌，严重损坏显微镜。
⒌仪器工作的间歇期间，为了防止灰尘进入镜筒或透镜表面，可将目镜留在镜筒上，或盖上防尘塞，或用防尘罩将仪器罩住。
⒍微镜尽可能不移动，若需移动应轻拿轻放，避免碰撞。
⒎不允许随意拆卸仪器，特别是中间光学系统或重要的机械部件，以免降低仪器的使用性能。
