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DS在多肽药物领域的解决方案 基于胰岛素肽的设计和筛选

北京创腾科技有限公司

2019/10/29 15:49:40

实施效果

来源:计算模拟平台

通过 Discovery Studio 软件设计指导了变构肽配体(Altered peptide ligands,APLs)用于治疗I型糖尿病。

 

方案详情

case3_fig1.png

 

I型糖尿病在人类和非肥胖糖尿病小鼠中均是一种自身免疫系统缺陷的疾病,有研究表明其主要由于 CD8+ T 细胞介导的β细胞损伤,使之不能正常分泌胰岛素。变构肽配体(Altered peptide ligands,APLs)可以有效抑制抗原-特异性T细胞失效,凋亡或转移。因此开发有效的 APLs 用于I型糖尿病的治疗很有必要。本文通过分子模拟技术对变构肽配体进行了设计和优化。

文章作者基于已知的变构肽配体与受体的复合物结构,首先通过 Discovery Studio突变了复合物结构中的关键氨基酸残基,确定了变构肽的关键改造位置,并设计了8个变构肽配体。然后结合DS_Loop refinement 和分子动力学程序 Standard Dynamics Cascade 对8个变构肽配体的复合物进行了结构模拟和优化,并基于MM-PBSA 方法预测了它们与受体之间的结合能,根据预测结果(表1)选择其中四个肽进行了合成和生物活性测试,其中变构肽 H6F 活性较好。针对 H6F 进行了后续的试验研究,试验结果表明变构肽配体 H6F 有希望成为一个治疗I类糖尿病的药物。

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