对消毒装置的维护而言主要有两个问题需要考虑: ①紫外灯的寿命;②石英套管结垢。
①紫外灯在使用过程中，随着时间的增加，紫外灯放出紫外线的强度会逐渐降低，因而在设计紫外线消毒系统的之中推荐使用的紫外灯替换时间大约是5000h，但在很多水厂中紫外灯的寿命超过8000h。在运行中当灯管的紫外线强度低于2500µW/ cm2时，就应该更换灯管，但由于测定紫外线强度较困难，实际上灯管的更换都以使用时间为标准，计数时除将连续使用时间累积之外，还需加上每次开关灯管对灯管的损耗，一般开关一次按使用3h计算。
②在紫外线消毒的过程中，由于水中存在的许多杂质会沉淀粘附在石英套管外壁上，引起套管结垢，从而使经过套管进入水中的紫外光的强度降低，当水中存在有高浓度的铁、钙或锰时，套管结垢非常迅速，因此需要定期对石英套管进行清洗。清洗方式可分为两大类:人工清洗和自动清洗。
(a)人工清洗就是将灯管从明渠中取出，用清洗液喷淋到套管上，然后用棉布擦拭清洁；或将几个紫外灯模块放到移动式清洗罐中用清洗液同时搅拌清洗，清洗罐中带有曝气搅拌装置；当灯管数量较多时，也可一次将整个灯组(由若干个模块组成)从明渠中起吊出来放入固定的清洗池内用清洗液清洗，池中带有曝气搅拌装置。从劳动强度和经济性上分析，人工清洗比较适合小型或中型污水处理厂。
(b)自动清洗还可分为纯机械式自动清洗和机械加化学式自动清洗。纯机械式自动清洗系统实际上是用铁氟龙环来回刮擦套管表面；而机械加化学式自动清洗系统则是在清洗头内装有清洗液，在清洗头机械刮擦套管表面的同时通过清洗头内的清洗液去掉难以通过刮擦有效去除的污垢。纯机械式自动清洗系统需要频繁（10一30min清洗一次)地来回刮擦以减缓套管表面污垢的积累，清洗头磨损快，寿命短，一般半年到一年就需要更换，维护要求劳动强度和清洗成本较高；机械加化学式自动清洗一般一天清洗一次，清洗头寿命在5年左右，清洗效果较好。
3.其他消毒设备
这里所指的消毒设备包括二氧化氯消毒设备、次氯酸钠消毒设备、臭氧消毒设备三种。这三种消毒系统均由消毒剂发生器、投加设备和接触反应池组成。
由于二氧化氯和臭氧有毒，不稳定，容易分解，需要现场制备。而次氯酸钠所含的有效氯易受日光、温度的影响而分解，一般情况下也采用现场制备。这三种消毒剂的发生器在国内均有厂家生产，用户可以根据具体的需要进行选择。
二氧化氯和次氯酸钠可以采用泵前插管或水射器等设备进行投加，接触反应池可以采用与氯消毒相同的反应池。由于二氧化氯气体有毒，因此在使用二氧化氯消毒时应该注意个人防护和通风。
由于臭氧是气体，为了提高臭氧的利用率和消毒效果，接触反应池建成水深为5一6m的深水池或建成封闭的几格串联的接触池，通过管式或板式微孔扩散器投加臭氧。扩散器用陶瓷或聚氯乙烯微孔塑料或不锈钢制成。接触池排出的剩余臭氧，具有腐蚀性，因此排出的剩余臭氧需进行消除处理。
