硅钼棒在高温使用过程中，表面会生成一层致密的二氧化硅保护膜，保护硅钼棒不再继续氧化。但是如果使用不当则会造成棒表面的保护膜不断脱落再形成，容易使硅钼棒损耗严重。
硅钼棒跟硅碳棒一样，在使用时分间断使用和连续使用，而且连续使用要比间断使用寿命长得多，一般在实验室使用时为间断使用，不停的重复升温保温降温的过程，造成硅钼棒表面产生热应力，引起保护膜的破裂、脱落等，然后再次生成保护膜，这个时候硅钼棒表面会产生凹坑，经过长时间使用，后在小截面处烧断。这就是典型的硅钼棒间断使用的损耗。实验室的间断使用不可避免，但是可以尽量的减少升温降温的次数，如果在升温和降温的过程中让温度变化差降低，会有效减少硅钼棒的损耗。
硅钼棒在工业上使用一般为连续使用，连续使用虽然比间断使用寿命要长的多，但是也是有避免不了的损耗的。首先在工业生产过程中虽然为连续使用，但是有时候需要停炉或者炉子维修，这时候就会产生间断使用的热应力效应，不过由于工业上间断的次数不多影响没那么大。然后是硅钼棒长时间高温使用，棒表面的保护膜会慢慢蒸发并且慢慢地再形成。在形成二氧化硅保护膜的同时，其中的钼元素会保留下来。当硅钼棒表面的硅的浓度太低不能形成二氧化硅时，就会使钼元素氧化挥发。挥发之后表面的二钼化硅重新裸露，然后重新生成保护膜。就这样不断循环重复以上过程，硅钼棒会越来越细，终烧断。所以说硅钼棒在工业上虽然为连续使用但是也是有避免不了的损耗的。
硅钼棒不管是连续使用还是间隔使用都是有损耗的。在使用过程中要尽量减少停炉的次数，并且尽量减小温度变化加速度，这样会有效减少硅钼棒的损耗。
