离子色谱技术应用于水质监测中的化学性质分析，主要用来测量其中的无机阴阳离子的分析，以及有机酸碱的分析。
前者来说，利用离子色谱分析技术监测水样中的无机阴阳离子，提升离子分析的效率和效果，能够将之前的25min左右才能分析出一种离子的低效监测能力，一下子可以显著提升至7min内能够分析出36种离子的高效监测效果。因此，离子色谱技术的应用推动了化学分析达到了发展。
就后者而言，将离子色谱技术应用于有机酸碱分析。在含有取代基、空基的酒酸、乳酸、柠檬酸等各种控酸、多基酸应用领域，这些多基酸或控酸难以使用气相色谱技术进行深度分析，而离子色谱技术的应用便有效地解决了这一难题，可以有效分析出被监测水质各液相中的有机酸、有机碱的组分情况。
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