水质在线分析仪在水质监测的实际工作中得到广泛的应用，不但提高了湖泊、海洋的水体质量，同业也提高的饮用水的质量。为水质监测工作者带来了便利，为了保证水质在线监测仪的使用寿命，仪器的维护可以几个方面进行：定期校验、多点线性检验以及定期清洗等。
根据仪器的校准周期，及被检测水体的水质状况来确定校准周期，如果水质状况较差，则仪器的校准周期就应该相应缩短。根据实际生产情况，在线监测仪器每月校准一次基本能够满足要求，一般不能超过仪器说明书规定的期限。仪器如果长时间停机后重新启动、更换电极、泵管等或更换不同批号的试剂等情况，则必须进行仪器的校准实验。
在仪器线性范围内均匀选择4-6个浓度的标准溶液进行测试，并计算其斜率和相关系数。如果发现标准曲线的斜率和相关系数发生显著的变化，在确保试剂质量以及非人为因素的前提下，应对监测仪器的性能进行检查。对仪器标准曲线的多点线性检验，一般每半年进行一次即可，可保证仪器处于良好运行状态。
水质在线分析仪本身一般具备在线清洗的功能，但如果水质较差，水中含有大量悬浮物质，随着时间的推移，采水和配水管路、反应池、传感器、电极和蠕动泵管等处会出现沉积物，会导致传感器灵敏性产生变化，或影响样品、试液注入到反应池中的体积，使检测分析仪器测定的结果产生偏差。
定期清洗维护可减少偏差，使误差有效地控制在范围之内。对管路以及传感器、蠕动泵管等进行清洗或更换后，对仪器进行重新标定，使系统始终处于良好的状态，保证监测数据的可靠性。同时，也可以适当延长仪器的使用寿命，可以提高监测准确性，使其数据具有代表性，同时，实现长周期有效平稳运行，为水质的监测工作提供更科学的指导。
