HPLC的保留值等色谱分析有关术语以及分配系数、分配比、塔板高度、分离度、选择性等方面均与气相色谱相一致;高效液相色谱所用基本理论：塔板理论与速率理论也与气相色谱一致。因液相色谱以液体代替气相色谱中的气体作流动相，则速率方程H=A+B/u + Cu式中：纵向扩散项(分子扩散项)B/u对板高的影响与气相色谱不同，由于液相色谱中组分分子在流动相中的扩散系数仅为气相色谱中的万分之一，因此纵向扩散项对板高的影响可以忽略不计于是影响液相色谱的主要因素是传质项Cu。气相色谱(GC)的流动相流速u增大时，板高H显著增大(即柱效显著降低)，而液相色谱(LC)的流速增大时。板高增大不显著(即柱效降低不显著)。这说明高效液相色谱也有很高的分离效能HPLC可分离分析高极性，高分子量和离子型的各种物质。柱效很高每米可达3万块以上，一般用20 -- 25cm长的柱子，由于固定相的不断改进，短的只有3cm ，理论板数可达3000—4000，能满足一般分析的需要，而且具有很高的分析速度柱子短，对压力要求就低过去高压，现在追求高精度，高稳定性，一般在室温下操作，样品不需预处理操作方便，容易掌握。
液相色谱非常适合分子量较大，难气化;不易挥发或对热敏感的物质，离子型化合物及高聚物的分离分析，大约占有机物的70～80%气相色谱的流动相载气是色谱惰性的性气体，不参与分配平衡过程,与样品分子无亲和作用，样品分子只与固定相相互作用。而在液相色谱中流动相是各种低沸点有机溶剂及水溶液。也参与样品分子相互作用，因此液相色谱流动相的作用比气相色谱大，气相色谱的载气仅数种，其性质差别也不大，对分离效果影响也不大。而液相色谱的流动相种类多，性质差别也大，对分离效果影响显著。因对于LC来说，流动相的选择很重要，为提高选择性增加了一个因素。液相色谱也可选用不同比例的两种或两种以上的液体作流动相,增大分离的选择性。
液相色谱能完成难度较高的分离工作.就其分离机理的不同，高效液液相色谱能完成难度较高的分离工作.就其分离机理的不同，高效液液相色谱能完成难度较高的分离工作.就其分离机理的不同，高效液液相色谱能完成难度较高的分离工作.就其分离机理的不同，高效液液相色谱能完成难度较高的分离工作.就其分离机理的不同，高效液相色谱可分为液-固吸附色谱;液-液分配色谱;离子交换色谱和凝胶渗透色谱等多种类型。液—固色谱的色谱柱内填充固体吸附剂，由于不同组分具有不同的吸附能力。因此，流动相带着被测组分经过色谱柱时，各组分被分开液—液色谱的流动相和固定相都是液体。作为固定相的液体涂在惰性担体上，流动相与固定液不互溶，当带有被测组分的流动相进入色谱柱时，组分在两相间很快达分配平衡，由于各组分在两相间分配系数不同而彼此分离。以非极性溶液作流动相,极性物质作固定相的液—液色谱叫正相色谱;极性溶液作流动相，非极性物质作固定相的液—液色谱叫反相色谱。离子交换色谱的色谱柱内填充离子交换树脂，依靠样品离子交换能力的差别实现分离。而凝胶色谱是按试样中分子大小的不同来进行分离的。在上述四类色谱中，应用较广泛的是液—液色谱。液相色谱作为分析时选择余地大，而气相色谱达不到。
