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一般分子生物学实验室常分为生化实验室与分子实验室两大类。
生化实验室主要是对化学生物进行科学研究，室内一般设生化室、药品仪器室、办公室，室内应根据其功能的要求设置给排水、通风系统、电源插座和总电源控制开关，并安装漏电保护器。
实验台、通风柜要求水、电到位，设有220V 的二孔、三孔插座各二个以上，实验员办公室不得设在化学实验室内。
分子生物学实验室基本要求
1、分子生物实验室依据所使用的方法可分为试剂准备、标本制备、扩增、产物分析等三或四个区域。只是使用实时荧光PCR仪、HIV病毒载量测定仪的PCR实验室，有上述前面三个区域即可。各区域应*独立分隔，不应有任何的空气直通。
2、产物分析区或三个区域的后一个区域 （即扩增及产物分析区），空气流向应由室外向室内，可通过在室内设置通风橱、排风扇或其他排风系统达到空气流由室外向室内流动的要求。
分子生物学实验室规划方案
分子生物研究和实验的常规方法，并没有严格的净化要求，但是为了避免各个实验区域间交叉污染的可能性，宜采用全送全排式气流组织形式。同时控制送、排风的比例以保证各实验区的压力要求。
将PCR过程分成试剂准备、标本制备和PCR扩增检测三个独立的实验区。整个区域有一个整体缓冲走廊。每个独立实验区设置有缓冲区，同时各区通过气压调节，使整个PCR实验过程中试剂和标本免受气溶胶的污染并降低扩增产物对人员和环境的污染。
可打开缓冲区Ⅰ，缓冲区Ⅱ和PCR扩增区的排风扇往外排气，在实验区的外墙上和各扇门上都安装有风量可调的回风口，空气通过回风口向室内换气。
试剂贮存和准备区：试剂和用于标本制作的材料应直接运送至该区，不得经过其它区域。对气流压力的控制，本区并没有严格的要求。
标本制备区：压力梯度要求为相对于临近区域为正压，以避免从邻近区域进入本区的气溶胶污染。另外，由于在加样操作中可能会发生气溶胶所致的污染，所以应避免在本区域内不必要的走动。
扩增反应混合物配制和扩增区：本区的压力梯度要求相对于邻近区域为负压，以避免气溶胶从本区域漏出。
扩增产物分析区：本区的压力梯度的要求为，相对于临近区域为负压，以避免扩增产物从本区域扩散至其它区域。
