超低温水汽捕集泵冷冻机配的冷凝器，运用时刻一长，功能就会逐步下降，其成果会使体系的冷凝压力高于正常运行时的冷凝压力。为了不使冷凝器的性质下降，需要定时对冷凝器进行保护保养。
超低温水汽捕集泵冷冻机中运用的冷凝器主要有风冷式冷凝器和水冷式冷凝器两种。依据冷凝器的类型不同，其清洗水垢的方法也不一样，这里介绍的是常用的两种冷凝器保护保养：
1、风冷式冷凝器是以空气作为冷却介质的，由于空气中常有尘埃，部分尘埃会粘结在冷凝器翅片的外表面上，时刻长了，会使冷凝器的散热效果变差，特别是环境比较恶劣的当地，因而应该定时进行清洗。清洗的方法是：单纯的尘埃可以用压缩机空气等吹干净，如果污物较多，应采用无腐蚀效果的清洗剂清洗散热管和翅片，到达改进散热效果的目的。
2、对于水冷式冷凝器，主要是清除水垢的问题。清除周期依水质而论，水质差的至少每年清洗一次；水质好的，可2~3年清洗一次。3、小型水冷式超低温水汽捕集泵冷冻机配用的冷凝器，可采用换热器清洗液进行清洗。具体的操作方法是：卸下冷凝器，放出积水，再向管内清洗液，直到出水口有溶液流出方位。清洗液冷凝器中逗留一段时间后即可放出，如此反复两三次，装上冷却水管与冷凝器的连接收，打开冷却水阀冲刷，防垢和清洗作业即告结束。
4、在超低温水汽捕集泵冷冻机制冷体系中，压缩机、蒸发器、冷凝器是制冷体系中重要的配件，冷凝器在这是归于放出热量的设备，将蒸发器中吸收的热量连同压缩机功所转化的热量一起传递给冷却介质带走，担负着制冷体系重要的人物之一，功能一下降，直接影响到超低温水汽捕集泵冷冻机的制冷能力。
