顶空瓶基本以玻璃材质为主，少是塑料材质。一次性使用的进样瓶成本高、浪费大、对环境污染严重，大多都是将进样瓶清洗后重复利用。目前，常用清洗进样瓶的方法主要都是加入洗衣粉、洗涤剂、有机溶剂及酸碱洗液，然后用定制的小试管刷洗。这种常规的刷洗法缺点很多，洗涤剂和水的使用量大，洗涤用时长，容易留有死角，如果是塑料进样瓶，易在内部瓶壁留下刷痕，占用大量人力资源。对于脂质和蛋白质残留污染严重的玻璃器皿，采用碱性裂解液进行清洗，取得良好的效果。
方案一：
1、倒干瓶内试液2、全部浸入95%酒精，超声洗2次后倒干，因为酒精易进入1.5mL的小瓶，且能与大多数有机溶剂互溶以达到清洗效果。3、倒入清水，超声洗2次。4、倒干瓶内洗液，于110摄氏度烘1~2小时，不能于高温下烘烤。5、冷却，保存。
方案二：
1、自来水冲洗几遍2、放入倒有纯水的烧杯中，超声15分钟3、换水，再超声15分钟4、泡在倒有无水乙醇的烧杯中5、后取出自然风干。
方案三：
1、先用甲醇(色谱纯）浸泡，并超声清洗20分钟，后将甲醇倒干.2、再将进样瓶内注满水，超声清洗20分钟，后将水倒干.3、后将进样瓶烘干
方案四：
（种）、一般都是先用清水冲洗烘干后再用硫酸重铬酸钾洗液浸泡（第二种）、进样瓶的洗法和做液相等其他是一样的，先使用医用酒精侵泡4个小时以上，然后超声半个小时，然后倒出医用酒精，使用水超声半个小时，用水冲洗后烘干就可以了。
