高效液相色谱法在临床实验室中对不同体液中生物标志物的分离和定量起了重要作用。HPLC与其他常规检测器（例如UV，荧光和电化学检测器）相比，更趋向于质量敏感检测。填充材料技术的进步，例如亚微米表面多孔二氧化硅颗粒已经被引入了超高压液相色谱中，在不遇到高背压的情况下提高了分离效率。
高效液相色谱仪的系统压力较高，色谱柱是产生系统压力的主要部件，高背压会影响很多方面比如反压太高超过流通池的耐受压力，会导致流通池的损坏。恒谱生液相色谱柱均一的粒径保证了流动相稳定的流动，并且确保色谱柱有着较低的柱压。
恒谱生分析保护柱也具有低背压，不漏液，死体积少等优点，能够减少液相色谱系统内的部分压力。
除此之外，其他先进技术的引用与结合，在不同程度上优化了液相色谱分析工作方法，例如高效的自动进样器，减少检测器的细胞体积以及数据收集和分析的改进等等。很多实验室每天需要生成数百个样本的多个参数的报告，这些方法都能节约工作时间与提升工作效率。
临床实验室通常处理数百种生物流体样本，例如血液，尿液和其他体液。需要有效的提取过程与快速分析相结合，才能快速处理如此繁重的工作，但又不影响分析的质量，患者的治疗方法与报告的准确性有很大关系，因此快又准的报告是重中之重。
本文简要讨论了临床实验室中一些常见的HPLC分析应用。
生物样品需要事先处理和加工，以消除来自其他成分的干扰，尤其是在血液等液体的情况下。采用溶剂萃取，超滤和固相萃取等方式可防止对检测产生干扰并且可防止色谱柱内部堵塞。预防色谱柱堵塞还可以借助一些液相分析耗材配件的帮助，比如在色谱柱前添加预柱（保护柱）起到过滤颗粒物，化学物，杂质等作用。这些污染物会污染色谱柱、堵塞色谱柱，恒谱生建议在色谱柱前安装分析保护柱可以起保护色谱柱、防止堵塞、延长色谱柱的寿命等作用。
除了安装保护柱，还可以安装在线过滤器来防止色谱柱堵塞，恒谱生在线过滤器由洁净的高品质不锈钢部件组成，这些过滤器旨在减少色谱柱入口筛板的污染和堵塞问题。
儿茶酚胺
儿茶酚胺是一种含有儿茶酚和胺基的神经类物质。儿茶酚胺充当神经递质和肾上腺激素。去甲肾上腺素，肾上腺素和多巴胺是可用于诊断是否患有帕金森氏病，高血压和肌营养不良。以前依靠使用电化学或荧光检测法检测尿液或血浆样品中的儿茶酚胺含量，而使用HPLC检测是一种便捷的新分析方法。
维他命
维他命在人体生长、代谢、发育过程中发挥着重要的作用。维他命在体内是微量的，在除去存在于体液（例如血液和脑脊髓液）中的干扰化合物后，HPLC提供了灵敏且可靠的维他命估算技术。虽然这样分析技术的成本十分高昂，但是由于具有超高灵敏度和快速处理繁重工作量的优势，一些大型临床实验室还是会采用这种技术。
糖尿病监测
糖尿病是以高血糖为特征的代谢性疾病。高血糖则是由于胰岛素分泌缺陷或其生物作用受损，或两者兼有引起。HPLC能准确定量地评估糖化血红蛋白被证明是有效控制血糖的监测技术。即使在收集样本两周后，也可以通过HPLC分析血红蛋白HbA1c在专用纸上收集并干燥的血斑。该方法为患者长期血糖控制提供了高灵敏度的检测。
