1、自然沉降法
自然沉降法是1881年由德国细菌学家Koch建立的，它是让测定区域空气中的微生物气溶胶颗粒由于重力作用，在一定时间内逐步沉降到带有培养介质平板内的一种采样方法。自然沉降法是空气中微生物气溶胶采集常用的方法之一，我国的医疗卫生机构在调查空气中微生物气溶胶的分布和粒谱时也常常选择自然沉降法，因为它使用方便，操作简单，经济，能够初步了解某环境空气中细菌的污染状况。
奥梅梁斯基公式具有局限性。奥梅梁斯基公式，即C=50000 N/AT（C为细菌浓度（cfu/m3），N为培养后平板上的菌落数， A为平板面积（cm2），T为暴露时间（min）），该公式忽略了颗粒大小这一基本因素。
短时间内难以测出空气中粒径较小的微生物气溶胶。通常认为5μm以下的颗粒是空气传播疾病的最危险颗粒。自然沉降法一般只能采集到＞8μm的微生物气溶胶，对于＜5μm的微生物气溶胶采样效率不高。
外界气流易对采样结果造成影响。在实践过程中很难控制采样条件，而自然沉降法采样条件要求静止无风，所以容易造成同一环境的多次采样结果有偏差。
2、撞击法
撞击法是指空气中微生物气溶胶颗粒获得足够的惯性后，脱离气流撞击于固体平板上的一种采样方法，这类采样器能作空气微生物的定量测定。
固体撞击式采样器最常见的是安德森（Andersen）采样器。此外，还有我国自行研制的JWL型采样器、THK系列和MTM系列采样器、英国的Casella裂隙式采样器等。
Andersen采样器是一种6级筛板式空气微生物采样器，通过模拟人体呼吸道的结构及空气动力学特征进行采样。Andersen采样器由6个带有400个微细圆形孔的金属撞击圆盘组成，每个圆盘的圆孔孔径由上到下递减，而气流速度则由上到下递增，盘下放置装有培养基的平板，使空气微生物气溶胶颗粒按其大小逐级撞击在6层培养基平板上。
Andersen采样器各级捕获的微粒直径为：第1级＞7.0μm；第2级4.7~7.0μm；第3级3.3~4.7μm；第4级2.1~3.3μm；第5级1.1~2.1μm；第6级0.65~1.1μm。
生物失活率低，存活率高。
敏感性高。由于Andersen采样器采样流量不大， 并且能够让采集到的活性颗粒立即进入有利于繁殖的条件。
采集粒谱范围宽。Andersen采样器可采集粒径在0.2~20μm范围内的微生物气溶胶
采样效率高。在适宜的采样范围内，Andersen采样器效率非常高，尤其是采集空气中的感染颗粒，即呼吸道易沉着颗粒。
操作简单，适宜范围广泛。
Andersen采样器的缺点:
3、冲击法
冲击式采样器中常用的是液体冲击式采样器Porton采样器、AGI-30采样器、Shipe采样器和多级液体撞击式采样器等。
Porton采样器是由英国生物研究中心Porton制造的，它使用方便、价格低廉、易消毒、可以反复使用、有效地延伸了采样器的检测范围，适用于高浓度的空气微生物采样。此外，采样液的保护作用使得Porton采样器可以采集到脆弱的微生物，如病毒和立克次氏体的采样。由于采样器采集的是液体样本，使用者可以随时对样本进行检测，了解空气中微生物的构成，测出空气中活微生物数量。
Porton采样器采集的是液体样本，所以可以同时进行多种实验，选用不同的测定方法分别分析。此外，可以加入适宜的营养液或保存液于液体样本中，使微生物能长期保存。
适宜进行长时间采样。不适宜现场多次采样。
在低温条件下不适宜采样。因为采样生物中生长，在低温条件下不适宜采样。因为采样液温度过低不利于微生物在液体中生长，采样液的适宜温度在10~20 ℃之间。
对于低浓度的微生物采样很难检测。
