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2021/7/13 9:29:37单细胞测序技术自2009年问世,2013年被Nature Methods评为年度技术以来,越来越多地被应用在科研领域。自此,单细胞测序技术被广泛应用于基础科研和临床研究。
单细胞在许多领域都占有一席之地,对于癌症早期的诊断、追踪以及个体化治疗具有重要意义。
基本原理
单细胞测序首先不是仅仅对一个细胞进行测序,而是说该项技术能对单一细胞的基因组或转录组进行测序,可以理解为单细胞水平上的测序。
为什么要进行单细胞测序?世界上没有两片相同的叶子,对于多细胞生物来说细胞与细胞之间是存在差异的,很多时候是基因组、转录组上的失之毫厘,功能上的差之千里。比如在肿瘤组织中,肿块中心的细胞与肿块周围的细胞,原发灶与转移灶的细胞,其基因组与转录组等遗传信息是存在差异的,这也就导致不同肿瘤细胞表现出免疫特性、生长速度、侵袭能力等表型方面的差异,最终导致对不同抗肿瘤药物的敏感性不同或放疗敏感性的差异。
传统测序方法所展示的信息也是在多细胞水平上的平均信息,而单细胞水平上的测序则*可以反应同一个细胞群里不同细胞的基因组和转录组状况。单细胞测序技术的出现,使得从混杂的样品中筛选出异质性信息的难题得以解决,该技术的成熟使用也必将生命科学研究向前迈进一大步
BD Rhapsody
BD Rhapsody™单细胞分析系统应运而生,此系统的诞生基于 BD 在细胞生物学领域 40年的专业技术,克服了传统检测的局限性,能够对成千上万个单细胞的数百个表达基因同时进行数字定量,每个细胞提取独立数据,体现异质性,可以鉴定和表征新型和罕见细胞类型,有助于理解从免疫学到肿瘤学等多个领域内的生物学过程。
BD重磅推出的Rhapsody™单细胞分析系统克服了传统检测的局限性,如微阵列和大量细胞 RNAseq,传统检测依赖于对多个细胞的平均检测,来实现对细胞间微妙差异的观察。与其他单细胞分析系统相比,BD Rhapsody™的特点及优势在于:
1.更高的采样灵敏度
靶向分析方法有助于提高单细胞测序效率,Rhapsody系统提供的检测试剂盒(panel)可稳定的重现细胞异质性的数据,可用于探索与众多应用相关的细胞类型。且与全转录组扩增的mRNA分析相比,Rhapsody系统对罕见转录有更低的检测阈值。
2.克服 PCR 偏差 — BD分子标签
当对序列读取进行计数时,PCR 扩增偏差可导致基因定量不准确。Rhapsody采用“分子标签”技术,能为单细胞中每个转录本标记特异性分子标签,实现了单细胞水平上基因表达谱的绝对定量,同时,每个细胞也会被标记特异性细胞标签,这使高通量平行建库成为可能。
3.单细胞成像系统
对单细胞分离过程进行质控,监控细胞存活率、单细胞分离效率,有效保证实验成功率。
4.更高的转录本检测特异性
系统通过*的数据分析流程,去除PCR错误扩增产物,降低细胞非特异性表达水平。
5.更高的分辨率
可以分辨更细分、微观的细胞群和细胞亚种群。
6.更经济的测序和设备预算
结合Rhapsody*的单细胞分离技术,单次实验可制备100-10000个单细胞文库,用户可根据需求定制引物,将检测范围集中在目标基因,大幅降低后续测序成本。
随着人们逐渐意识到单细胞研究对认识人自身以及疾病的重要性,单细胞测序技术的诞生恰逢其时。目前单细胞测序已经广泛用于微生物学、神经学、人体发育、免疫、癌症、辅助生殖等领域的研究。相信此次BD Rhapsody单细胞分析系统的闪亮登场,能够为目前高速发展中的精准医学带来浓墨重彩的一笔。