进样瓶清洗机工作过程有以下几个步骤:
1、预清洗
将器皿内附着力较小的杂质清除干净，完成粗洗。预清洗过程为:使用高压水柱喷射设定时间，对器皿内壁进行清洗，再进自来水，将器皿泡在水中，支架高速旋转，对器皿外壁清洗时间，然后排水，如此重复设定次数。
2、浸泡
机器自动加入一定比例的清洗剂(也可以不添加清洗剂)，和自来水混合，并将混合液加热到设定温度。器皿浸泡设定时间，使附着力较强的杂质充分溶解。在浸泡的过程中，高压水泵被打开，向器皿内注入液体，可使器皿充满液体。为后面的超声波清洗做准备(超声要求器皿必需充满液体)。
3、超声清洗
在浸泡时间结束后，超声波清洗系统被打开，超声波清洗具有*的特点，只要有液体充满的地方，超声波都可以发挥作用，可将不易清洗的死角*清洗干净。在超声波的作用下，迅速地将杂质同器皿剥离，超声结束后水自动排空。
4、中和
浸泡时使用的清洗剂通常是低残留的碱性清洗剂，为消除清洗剂残留，可以使用酸性清洗剂中和，该过程按照一定的比例加入酸性清洗剂和水，中和可能残留的碱性清洗剂。如果浸泡过程没有使用清洗剂，该步骤可省略。
5、中和后超声
第二次使用超声波清洗进样瓶，增加清洗效果。等同于浸泡之后的超声动作。
6、漂洗
7、淋洗
