根据DNA扩增的目的和检测的标准，可将仪器分为普通基因扩增仪，梯度基因扩增仪，原位PCR基因扩增仪，实时荧光定量基因扩增仪四类，下面我们就来看下他们具体的特色：
1、普通的基因扩增仪：把一次PCR扩增只能运行一个特定退火温度的PCR仪，叫传统的PCR仪，也叫普通PCR仪。如果要做不同的退火温度需要多次运行。主要是做简单的，对目的基因退火温度的扩增。该仪器主要应用于科研研究，教学，医学临床，检验检疫等机构。
2、梯度基因扩增仪：把一次性pcr扩增可以设置一系列不同的退火温度条件(温度梯度)，通常12种温度梯度，这样的仪器就叫梯度PCR仪。因为被扩增的不同DNA片段，其合适退火温度不同，通过设置一系列的梯度退火温度进行扩增，从而一次性PCR扩增，就可以筛选出表达量高的合适退火温度，进行有效的扩增。
3、原位基因扩增仪：用于从细胞内靶DNA的定位分析的细胞内基因扩增仪，如病源基因在细胞的位置或目的基因在细胞内的作用位置等。是保持细胞或组织的完整性，使PCR反应体系渗透到组织和细胞中，在细胞的靶DNA所在的位置上进行基因扩增，不但可以检测到靶DNA，又能标出靶序列在细胞内的位置，于分子和细胞水平上研究疾病的发病机理和临床过程及病理的转变有重大的实用价值。
4、实时荧光定量基因扩增仪：在普通基因扩增仪的基础上增加一个荧光信号采集系统和计算机分析处理系统，就成了PCR基因扩增仪。其PCR扩增原理和普通PCR仪扩增原理相同，只是PCR扩增时加入的引物是利用同位素、荧光素等进行标记，使用引物和荧光探针同时与模板特异性结合扩增。扩增的结果通过荧光信号采集系统实时采集信号连接输送到计算机分析处理系统得出量化的实时结果输出。把这种基因扩增仪叫做实时荧光定量PCR仪。
