目前，越来越多的工业化实验室和科研院所的实验室开始使用机器人或自动化仪器开展日常工作和科学研究。费时、费力的重复性工作实现自动化在许多行业已经成为趋势，例如食品加工业、药物筛选以及基因组测序。与传统的手工操作方法相比，这种自动化不但大大提高了工作效率，而且极大地减少了人工操作可能带来的错误。
除了微生物基因分型实验室，自动化液体工作站还能够用在食品检测实验室、法医学实验室等多种实验室中。除此之外，自动化液体工作站还有更广泛的应用实验领域：
1. 定量 PCR。此类的实验不同于定性 PCR 反应，对样品处理需要更高的精确度和准确度，以避免由于加样的实验误差，而造成假性的高反应产物。配合定量PCR，可以保证反应结果的可靠性。
2. 酶标反应。由于可更换的吸嘴，可以避免传统的管道式加样导致的反应物的污染。
3. 荧光和化学发光高通量检测蛋白。配合读板式的荧光和化学发光高通量的蛋白检测仪，更高效率、更准确地定量蛋白质。
4. 基因工程等，如可以将需要的细胞或者细菌克隆从 24 板或者其他的培养中取出，按照自己设计的次序，重新排列克隆。
5. 生物制剂或者生物制药中试试验。自动化液体工作站除了可以处理板与板之间的液体转移，还可处理管与板，或者玻璃试管与离心管等等其他大多数自动加样工作站无能为力的特殊加样工作，所以其应用可涉及更广的范围。
