菌落计数器采用的是平板计数法，经过培养后数出平板上所生长出的菌落个数，从而计算出每毫升或每克待检样品中可以培养出多少个菌落，以CFU/ml或CFU/g报告。菌落计数器可以判定食品被污染的程度，也可以用于观察细菌对食品污染的程序，同时还可以用于观察细菌在食品繁殖的动态，以便对被检样品进行卫生学评价时提供依据。
JJ-2型菌落计数器是一种数字显示式半自动细菌检验仪器。由计数器、探笔、计数池等部分组成。广泛用于食品、饮料、药品、生物制品、卫生用品、饮用水、工业废水、临床标本中细菌数的检验。
使用方法介绍：
a .接通电源，拨动开关计数池内灯亮，显示屏显示“001”，将探笔插头插入仪器的插孔内，按下“复位”键调零使仪器进入工作状态。
b.放入待检培养皿。
c.用探笔在培养皿底面对所有的菌落逐个点数。每点一个应听到“嘟”声才说明有效，否则应重点。此时，点到的菌落被标上颜色，显示数字自动累加。
d.用放大镜仔细检查，确认点数无遗漏，计数即已完毕。
e.显示屏内的数字即为该培养皿的菌落数。
f.记录数字后取出培养皿。按“复位”键，显示屏进入初始状态。
