底栖动物是指在水地区栖息的动物总称，一般包括水生环节动物、水生软体动物、甲壳动物和水生昆虫。底栖动物调查的目的在于了解水体中底栖动物的种类组成，分布以及对水体单位面积上底栖动物的平均密度和生物量作出比较可靠的估计，从而为水体中底层鱼类的放养指标提供一定的依据，还可用这些调查数据评述水体的污染程度。
盒式采泥器及蚌斗式采泥器（即改良彼得生采泥器）。其原理是利用采集工具本身具有的重量，沉入水底，取出一定面积的底泥，从而推算某一水体中底栖生物的数量。此外还简介带网夹泥器。
采泥器呈长方形，适于在水深7米以内的水库或湖泊中作业。作业时垂直切割底泥，采集面积为192cm2，深度可达10~15米。采集时，打开阀门，接上竹竿（或铁管等，闭锁阀门的拉升附于其上），然后放入水底，接触底泥时用力往下捺压，使采泥器切入底泥，随即提拉闭锁阀门的绳子，使其关闭阀门，然后将采泥器提出水面，打开阀门，底泥就坠落于一定的容器中，即采的样品。盒式采泥器携带轻便，结构简单，易于操作。在池塘等小水体采样时，人立于池即可操作。
式样多种，携带较方便。采集面积为1/16m2或1/20m2。如图所示，1为一对蚌斗式铁勺，上部较重，以绳挂于活钩2上，然后将采集器迅速沉入水底，当铁勺与水底接触后，放松拉绳，活钩即形脱落，当向上提拉屎，绳子即将铁勺拉紧，铁勺自然夹拢，将底泥样夹在其中，多余的水，自每半铁勺的方孔4中流出，提高水面后倾入盒中，即采的泥样。用来采集昆虫幼虫和寡毛类及小型软体动物。
采样的代表性要强，因此应选择那些水域特性的地区和地带，如水库、江河流域内的库湾部分，水库的近坝区，消落区，沉入水下的旧河床地段等。采样点要反映整个水体的基本状况，因此在选点之前，要根据水体的详细地形图，对其形态及环境进行了解，从而根据不同环境特点（如水深、底质、水生植物等等）设置断面和采样点。断面上设置的点是直线的，每隔一定距离设一采样点。断面上采样点的多寡使环境而酌情增减，通常设断面必须考虑几个因素：如底质、水深、水生高等植物的组成、如水口、出水口、湖湾，以及受污染地区等。断面和采样点的设置多少，是具体情况而定。每一段面积断面上的每一采样点的位置都需标在地图上。
