在进行总氮和氨氮的检测时，使用较多的方法分别是《碱性过硫酸钾消解紫外分光光度法》（HJ636-2012）和《纳氏试剂分光光度法》（HJ535-2009）。总氮的定义是水中各种形态无机和有机氮的总量，包括NO3-、NO2-和 NH4+等无机氮和蛋白质、氨基酸和有机胺等有机氮，以每升水含氮毫克数计算。氨氮是指水中以游离氨（NH3）和铵离子（NH4+）形式存在的氮。两者常被用来表示水体受营养物质污染的程度。
理论上总氮等于氨氮、有机氮与硝态氮的和，在实际的实验中往往达不到理论上的结果，部分样品会存在氨氮 ≥ 总氮。为什么会出现这种倒挂的情况，是哪一步出现了问题？
因为样品中的氮化合物是不断变化的，所以在水样采集过后应立即检测或者放入冰箱低于 4℃的条件下保存，但不得超过24h。 如果长时间存放，可在1000ml 水样中加入0.5ml 硫酸（1.84g/ml），酸化pH小于2，并尽快测量。在样品分取过程中应考虑到与外界空气交叉污染的可能性，应做到与外界空气交叉污染的可能性，应做到取完样品后及时密封样品。避免受光照带来的温度变化和实验室内部环境造成的误差影响。
总氮和氨氮的分析都应在无氨的实验室环境中进行，环境内不应含有石油类及其他的氮化合物，绝对不能在分析氨氮等氮类项目的实验室中做总氮项目的分析，所使用的试剂、玻璃器皿等也要单独存放并保持干燥与清洁，避免交叉污染。
配制任何溶液都离不开水这种介质，首先是无氨水的制备，因为在制备无氨水的过程中，不可避免会使空气中的氨或者铵盐溶于水中，使试剂用水受到污染。这种环境就会对试剂空白带来难以消除的误差。尤其会增大总氮的试剂空白，使总氮检测值较实际值偏小。所以当无氨纯水制备完以后，一定要妥善保存，尽可能做到随用随制。由于测定总氮是利用《碱性过硫酸钾消解紫外分光光度法》（GB11894—89），虽然此种方法步骤较为简单，对仪器要求也不高，但是对空白试验的吸光度要求苛刻，其中影响空白的主要因素就是过硫酸钾的质量，在此推荐配制碱性过硫酸钾溶液的过程中，首先配制氢氧化钠溶液，然后配制过硫酸钾溶液。由于过硫酸钾溶解非常慢，可以采用水浴加热，并且使加热温度控制到 55℃～60℃之间，当过硫酸钾溶液充分溶解并冷却到室温后，缓慢地加入到氢氧化钠溶液中并同时搅拌，防止氢氧化钠放热使溶液温度过高引起局部过硫酸钾失效。当过硫酸钾试剂质量不合格时，会导致空白值较高，甚至会严重影响样品结果。因此配制碱性过硫酸钾溶液时尽可能使水浴温度控制到 50℃～60℃之间，否则将会使过硫酸钾分解导致失效，影响结果。
由于用《纳氏试剂分光光度法》测定氨氮过程中没有什么繁琐的步骤，只需要 10min 的显色时间，检测期间几乎没有氨氮的损耗，而在总氮的检测过程中，分解出的原子态氧在 120℃～124℃的条件下消解 30min，可使水样中的含氮化合物的氮元素转化为硝酸盐，根据在波长 220nm 和 275nm 吸光度推算出总氮含量。但是往往由于高压锅内温度和试剂等问题导致过硫酸钾消解不*，比色管磨口塞子没有*封闭，造成消解过程中氨的挥发以及样品蒸发，导致随后加纯水至标线，样本体积增大而使总氮含量偏小，从而引起总氮小于或者等于氨氮的可能。
由于水样不经过处理或者凝聚沉淀不*导致氨氮结果偏大，而在总氮测定时水样的色度和混浊物经过 40min 的高温消解后可以发现比色管底部有白色沉淀并且水样无色透明，从而消除了对总氮结果的影响。所以在氨氮检测时如果凝聚沉淀不能够去除色度和*沉淀，那么就采用蒸馏法沉淀，这样可以更好地消除氨氮结果偏大所带来的影响。
配置氨氮所需药品时，要注意当酒石酸钾钠铵盐含量较高时，会导致氨氮含量偏大而使结果大于总氮。酒石酸钾钠仅仅加热煮沸不能*除去氨，还应该加入少量的氢氧化钠溶液，煮沸蒸发掉溶液体积的 25%左右，冷却后用无氨水稀释至原体积，从而有效减少酒石酸钾钠溶液中的铵盐，使结果更具有准确性。1、总氮和氨氮项目应在接到水样的第一时间检测，并且需要两人分别同时检测，这样可以大化避免不同时间检测所带来的影响。2、严格控制总氮测定所需试剂的质量和配制全过程，避免总氮消解不*所带来的影响。3、处理好氨氮检测前的色度、浑浊度和影响氨氮值偏大等因素。
