红外光谱仪不能正常工作时，可先启动仪器自诊断功能，检查仪器某些器件工作状况，或者根据仪器的异常现象，参照仪器使用说明书进行排查。
若发现是光谱仪硬件损坏，应请专业维修工程师来现场处理，若无法查出故障原因，也应及早与维修工程师沟通，及时传递仪器的故障信息。以便工程师来现场维修之前能大概判定故障原因并准备好所需的备品备件。如果故障原因不是硬件问题，可通过调整、重新设置光谱仪参数等技术操作解决的，可自行处理。
下面为一些常见红外光谱仪故障及排査方法。
红外光谱仪干涉图能量低，导致信噪比不理想。
可能原因：
1.光路准直未调节好或非智能红外附件位置未调整到正确位置;2.红外光源已损坏或能量已衰竭;3.检测器已损坏或MCT检测器无液氮;4.分束器损坏;5.各种红外反射镜或红外附件的镜面太脏;6.光阑孔径太小或信号增益倍数太小;7.圆光路中有衰减器。
红外光谱仪排除方法：
1.启动光路自动准直程序，如果正在使用非智能红外附件，则还需要人工准直;2.更换红外光源;3.请维修工程师检查，必要时更换检测器(检测器损坏很有可能是由于受潮引起，因此更换后应注意保持仪器室的干燥，对于MCT检测器可添加液氮再重新检查;4.请维修工程师检查，必要时更换分束器(分束器损坏很可能是由于受潮引起或更换时碰撞产生裂痕引起，因此更换后应注意保持仪器室的干燥，从仪器上取出或装入时一定要非常小心);5.请维修工程师清洗;6.重新设置光阑孔径或信号增益倍数，使之处于适当值;7.取下光路中的衰减器。
