微波化学合成仪的微波是一种高频率的电磁波，其本身并不产生热。自然界的微波因为分散不集中，故不能作为一种能源，而利用的磁控管则可将电能转变为微波，以每秒2450MHz的振荡频率穿透介质，当介质有合适的介电常数和介质耗损时，便会在交变得电磁场中发生高频振荡，使能量在介质内部积蓄起来。对化学反应而言，可同时产生热效应和非热效应。
四氟乙烯等非极性材料；但在金属表面会被反射。家用微波炉磁控管的功率输出是基本固定的，较小功率依靠改变电流的通/断时间（占比空）来实现的。微电脑使用电流的通/断能够较严格地定时实行，选择相同的工作状况可以获得重复的化学反应条件。
微波化学合成仪的保养
1、清洗微波化学合成仪前请务必拔下电源插头。
2、可用蘸有软性洗涤性（如洗洁精）的布擦拭微波炉外壳，并用微湿布擦净，然后再用干布擦干，不要让水分渗入炉腔，严禁使用钢丝刷等硬物擦拭微波炉。
3、请勿用不良清洗剂及腐蚀性、挥发性的化学溶剂擦拭炉身，以免炉身受损。
4、必须经常清洗炉腔内留下的污垢，以免影响加热效果。
5、必须保持仪器底部清洁，避免转盘转动时发生噪音。
6、保持仪器波导口的清洁，请不要把波导盖（云母片）取下，以免打火。
7、经常保持仪器接合处清洁。
8、不使用仪器时请拔掉电源插头。
9、由于仪器工作电流大，请用专业插座，不要与其他耗电量大的电器（特别是空调、取暖器等）共用一个插座，以免造成短路过载，引起火灾。
